JAL-4034 allow a jalview_property to set the threshold level
[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / jalview / DoubleMatrix.java
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3 // See https://eclipse-ee4j.github.io/jaxb-ri 
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5 // Generated on: 2021.08.30 at 11:05:22 AM BST 
6 //
7
8 package jalview.xml.binding.jalview;
9
10 import java.util.ArrayList;
11 import java.util.List;
12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
15 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
16 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
17
18 /**
19  * <p>Java class for DoubleMatrix complex type.
20  * 
21  * <p>The following schema fragment specifies the expected content
22  * contained within this class.
23  * 
24  * <pre> <complexType name="DoubleMatrix">
25  * <complexContent> <restriction
26  * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType">
27  * <sequence> <element name="row"
28  * type="{www.jalview.org}DoubleVector" maxOccurs="unbounded"
29  * minOccurs="0"/> <element name="D"
30  * type="{www.jalview.org}DoubleVector" minOccurs="0"/> <element
31  * name="E" type="{www.jalview.org}DoubleVector" minOccurs="0"/>
32  * </sequence> <attribute name="rows"
33  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}int" /> <attribute
34  * name="columns" type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}int" />
35  * </restriction> </complexContent>
36  * </complexType> </pre>
37  * 
38  * 
39  */
40 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
41 @XmlType(
42   name = "DoubleMatrix",
43   namespace = "www.jalview.org",
44   propOrder =
45   { "row", "d", "e" })
46 public class DoubleMatrix
47 {
48
49   protected List<DoubleVector> row;
50
51   @XmlElement(name = "D")
52   protected DoubleVector d;
53
54   @XmlElement(name = "E")
55   protected DoubleVector e;
56
57   @XmlAttribute(name = "rows")
58   protected Integer rows;
59
60   @XmlAttribute(name = "columns")
61   protected Integer columns;
62
63   /**
64    * Gets the value of the row property.
65    * 
66    * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not a
67    * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will be
68    * present inside the JAXB object. This is why there is not a
69    * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the row property.
70    * 
71    * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
72    * getRow().add(newItem); &lt;/pre&gt;
73    * 
74    * 
75    * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
76    * {@link DoubleVector }
77    * 
78    * 
79    */
80   public List<DoubleVector> getRow()
81   {
82     if (row == null)
83     {
84       row = new ArrayList<DoubleVector>();
85     }
86     return this.row;
87   }
88
89   /**
90    * Gets the value of the d property.
91    * 
92    * @return possible object is {@link DoubleVector }
93    * 
94    */
95   public DoubleVector getD()
96   {
97     return d;
98   }
99
100   /**
101    * Sets the value of the d property.
102    * 
103    * @param value
104    *          allowed object is {@link DoubleVector }
105    * 
106    */
107   public void setD(DoubleVector value)
108   {
109     this.d = value;
110   }
111
112   /**
113    * Gets the value of the e property.
114    * 
115    * @return possible object is {@link DoubleVector }
116    * 
117    */
118   public DoubleVector getE()
119   {
120     return e;
121   }
122
123   /**
124    * Sets the value of the e property.
125    * 
126    * @param value
127    *          allowed object is {@link DoubleVector }
128    * 
129    */
130   public void setE(DoubleVector value)
131   {
132     this.e = value;
133   }
134
135   /**
136    * Gets the value of the rows property.
137    * 
138    * @return possible object is {@link Integer }
139    * 
140    */
141   public Integer getRows()
142   {
143     return rows;
144   }
145
146   /**
147    * Sets the value of the rows property.
148    * 
149    * @param value
150    *          allowed object is {@link Integer }
151    * 
152    */
153   public void setRows(Integer value)
154   {
155     this.rows = value;
156   }
157
158   /**
159    * Gets the value of the columns property.
160    * 
161    * @return possible object is {@link Integer }
162    * 
163    */
164   public Integer getColumns()
165   {
166     return columns;
167   }
168
169   /**
170    * Sets the value of the columns property.
171    * 
172    * @param value
173    *          allowed object is {@link Integer }
174    * 
175    */
176   public void setColumns(Integer value)
177   {
178     this.columns = value;
179   }
180
181 }