JAL-4034 allow a jalview_property to set the threshold level
[jalview.git] / src / jalview / xml / binding / jalview / Mapping.java
1 //
2 // This file was generated by the Eclipse Implementation of JAXB, v2.3.3 
3 // See https://eclipse-ee4j.github.io/jaxb-ri 
4 // Any modifications to this file will be lost upon recompilation of the source schema. 
5 // Generated on: 2021.08.30 at 11:05:22 AM BST 
6 //
7
8 package jalview.xml.binding.jalview;
9
10 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
11 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
13 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
14 import javax.xml.bind.annotation.XmlRootElement;
15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
16
17 /**
18  * 
19  * Represent the jalview.datamodel.Mapping object - it also provides a way of
20  * storing sequences that are mapped 'to' without adding them to the sequence
21  * set (which will mean they are then added to the alignment too).
22  * 
23  * 
24  * <p>Java class for anonymous complex type.
25  * 
26  * <p>The following schema fragment specifies the expected content
27  * contained within this class.
28  * 
29  * <pre> <complexType> <complexContent>
30  * <extension
31  * base="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}mapListType">
32  * <sequence> <choice minOccurs="0"> <element
33  * ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}Sequence"/> <element
34  * name="dseqFor"> <simpleType> <restriction
35  * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string">
36  * </restriction> </simpleType>
37  * </element> </choice> </sequence>
38  * <attribute name="mappingType"
39  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" />
40  * </extension> </complexContent>
41  * </complexType> </pre>
42  * 
43  * 
44  */
45 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
46 @XmlType(name = "", propOrder = { "sequence", "dseqFor" })
47 @XmlRootElement(name = "Mapping")
48 public class Mapping extends MapListType
49 {
50
51   @XmlElement(name = "Sequence")
52   protected Sequence sequence;
53
54   protected String dseqFor;
55
56   @XmlAttribute(name = "mappingType")
57   protected String mappingType;
58
59   /**
60    * Gets the value of the sequence property.
61    * 
62    * @return possible object is {@link Sequence }
63    * 
64    */
65   public Sequence getSequence()
66   {
67     return sequence;
68   }
69
70   /**
71    * Sets the value of the sequence property.
72    * 
73    * @param value
74    *          allowed object is {@link Sequence }
75    * 
76    */
77   public void setSequence(Sequence value)
78   {
79     this.sequence = value;
80   }
81
82   /**
83    * Gets the value of the dseqFor property.
84    * 
85    * @return possible object is {@link String }
86    * 
87    */
88   public String getDseqFor()
89   {
90     return dseqFor;
91   }
92
93   /**
94    * Sets the value of the dseqFor property.
95    * 
96    * @param value
97    *          allowed object is {@link String }
98    * 
99    */
100   public void setDseqFor(String value)
101   {
102     this.dseqFor = value;
103   }
104
105   /**
106    * Gets the value of the mappingType property.
107    * 
108    * @return possible object is {@link String }
109    * 
110    */
111   public String getMappingType()
112   {
113     return mappingType;
114   }
115
116   /**
117    * Sets the value of the mappingType property.
118    * 
119    * @param value
120    *          allowed object is {@link String }
121    * 
122    */
123   public void setMappingType(String value)
124   {
125     this.mappingType = value;
126   }
127
128 }