src/jalview/xml/binding/jalview/VAMSAS.java

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   8 package jalview.xml.binding.jalview;
   9
  10 import java.util.ArrayList;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  16
  17 /**
  18  * &lt;p&gt;Java class for VAMSAS complex type.
  19  *
  20  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content
  21  * contained within this class.
  22  *
  23  * &lt;pre&gt; &amp;lt;complexType name="VAMSAS"&amp;gt;
  24  * &amp;lt;complexContent&amp;gt; &amp;lt;restriction
  25  * base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  26  * &amp;lt;sequence&amp;gt; &amp;lt;element name="Tree"
  27  * type="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string" maxOccurs="unbounded"
  28  * minOccurs="0"/&amp;gt; &amp;lt;element
  29  * ref="{www.vamsas.ac.uk/jalview/version2}SequenceSet" maxOccurs="unbounded"
  30  * minOccurs="0"/&amp;gt; &amp;lt;/sequence&amp;gt; &amp;lt;/restriction&amp;gt;
  31  * &amp;lt;/complexContent&amp;gt; &amp;lt;/complexType&amp;gt; &lt;/pre&gt;
  32  *
  33  *
  34  */
  35 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  36 @XmlType(name = "VAMSAS", propOrder = { "tree", "sequenceSet" })
  37 public class VAMSAS
  38 {
  39
  40   @XmlElement(name = "Tree")
  41   protected List<String> tree;
  42
  43   @XmlElement(name = "SequenceSet")
  44   protected List<SequenceSet> sequenceSet;
  45
  46   /**
  47    * Gets the value of the tree property.
  48    *
  49    * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not a
  50    * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will be
  51    * present inside the JAXB object. This is why there is not a
  52    * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the tree property.
  53    *
  54    * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
  55    * getTree().add(newItem); &lt;/pre&gt;
  56    *
  57    *
  58    * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
  59    * {@link String }
  60    *
  61    *
  62    */
  63   public List<String> getTree()
  64   {
  65     if (tree == null)
  66     {
  67       tree = new ArrayList<String>();
  68     }
  69     return this.tree;
  70   }
  71
  72   /**
  73    * Gets the value of the sequenceSet property.
  74    *
  75    * &lt;p&gt; This accessor method returns a reference to the live list, not a
  76    * snapshot. Therefore any modification you make to the returned list will be
  77    * present inside the JAXB object. This is why there is not a
  78    * &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the sequenceSet property.
  79    *
  80    * &lt;p&gt; For example, to add a new item, do as follows: &lt;pre&gt;
  81    * getSequenceSet().add(newItem); &lt;/pre&gt;
  82    *
  83    *
  84    * &lt;p&gt; Objects of the following type(s) are allowed in the list
  85    * {@link SequenceSet }
  86    *
  87    *
  88    */
  89   public List<SequenceSet> getSequenceSet()
  90   {
  91     if (sequenceSet == null)
  92     {
  93       sequenceSet = new ArrayList<SequenceSet>();
  94     }
  95     return this.sequenceSet;
  96   }
  97
  98 }