src/jalview/xml/binding/uniprot/PhysiologicalReactionType.java

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   8
   9 package jalview.xml.binding.uniprot;
  10
  11 import java.util.ArrayList;
  12 import java.util.List;
  13 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessType;
  14 import javax.xml.bind.annotation.XmlAccessorType;
  15 import javax.xml.bind.annotation.XmlAttribute;
  16 import javax.xml.bind.annotation.XmlElement;
  17 import javax.xml.bind.annotation.XmlType;
  18
  19
  20 /**
  21  * Describes a physiological reaction.
  22  *
  23  * &lt;p&gt;Java class for physiologicalReactionType complex type.
  24  *
  25  * &lt;p&gt;The following schema fragment specifies the expected content contained within this class.
  26  *
  27  * &lt;pre&gt;
  28  * &amp;lt;complexType name="physiologicalReactionType"&amp;gt;
  29  *   &amp;lt;complexContent&amp;gt;
  30  *     &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}anyType"&amp;gt;
  31  *       &amp;lt;sequence&amp;gt;
  32  *         &amp;lt;element name="dbReference" type="{http://uniprot.org/uniprot}dbReferenceType"/&amp;gt;
  33  *       &amp;lt;/sequence&amp;gt;
  34  *       &amp;lt;attribute name="direction" use="required"&amp;gt;
  35  *         &amp;lt;simpleType&amp;gt;
  36  *           &amp;lt;restriction base="{http://www.w3.org/2001/XMLSchema}string"&amp;gt;
  37  *             &amp;lt;enumeration value="left-to-right"/&amp;gt;
  38  *             &amp;lt;enumeration value="right-to-left"/&amp;gt;
  39  *           &amp;lt;/restriction&amp;gt;
  40  *         &amp;lt;/simpleType&amp;gt;
  41  *       &amp;lt;/attribute&amp;gt;
  42  *       &amp;lt;attribute name="evidence" type="{http://uniprot.org/uniprot}intListType" /&amp;gt;
  43  *     &amp;lt;/restriction&amp;gt;
  44  *   &amp;lt;/complexContent&amp;gt;
  45  * &amp;lt;/complexType&amp;gt;
  46  * &lt;/pre&gt;
  47  *
  48  *
  49  */
  50 @XmlAccessorType(XmlAccessType.FIELD)
  51 @XmlType(name = "physiologicalReactionType", propOrder = {
  52     "dbReference"
  53 })
  54 public class PhysiologicalReactionType {
  55
  56     @XmlElement(required = true)
  57     protected DbReferenceType dbReference;
  58     @XmlAttribute(name = "direction", required = true)
  59     protected String direction;
  60     @XmlAttribute(name = "evidence")
  61     protected List<Integer> evidence;
  62
  63     /**
  64      * Gets the value of the dbReference property.
  65      *
  66      * @return
  67      *     possible object is
  68      *     {@link DbReferenceType }
  69      *
  70      */
  71     public DbReferenceType getDbReference() {
  72         return dbReference;
  73     }
  74
  75     /**
  76      * Sets the value of the dbReference property.
  77      *
  78      * @param value
  79      *     allowed object is
  80      *     {@link DbReferenceType }
  81      *
  82      */
  83     public void setDbReference(DbReferenceType value) {
  84         this.dbReference = value;
  85     }
  86
  87     /**
  88      * Gets the value of the direction property.
  89      *
  90      * @return
  91      *     possible object is
  92      *     {@link String }
  93      *
  94      */
  95     public String getDirection() {
  96         return direction;
  97     }
  98
  99     /**
 100      * Sets the value of the direction property.
 101      *
 102      * @param value
 103      *     allowed object is
 104      *     {@link String }
 105      *
 106      */
 107     public void setDirection(String value) {
 108         this.direction = value;
 109     }
 110
 111     /**
 112      * Gets the value of the evidence property.
 113      *
 114      * &lt;p&gt;
 115      * This accessor method returns a reference to the live list,
 116      * not a snapshot. Therefore any modification you make to the
 117      * returned list will be present inside the JAXB object.
 118      * This is why there is not a &lt;CODE&gt;set&lt;/CODE&gt; method for the evidence property.
 119      *
 120      * &lt;p&gt;
 121      * For example, to add a new item, do as follows:
 122      * &lt;pre&gt;
 123      *    getEvidence().add(newItem);
 124      * &lt;/pre&gt;
 125      *
 126      *
 127      * &lt;p&gt;
 128      * Objects of the following type(s) are allowed in the list
 129      * {@link Integer }
 130      *
 131      *
 132      */
 133     public List<Integer> getEvidence() {
 134         if (evidence == null) {
 135             evidence = new ArrayList<Integer>();
 136         }
 137         return this.evidence;
 138     }
 139
 140 }