src/org/biojava/dasobert/das/SpiceDasSource.java

   1 /*
   2  *                    BioJava development code
   3  *
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  11  * Copyright for this code is held jointly by the individual
  12  * authors.  These should be listed in @author doc comments.
  13  *
  14  * For more information on the BioJava project and its aims,
  15  * or to join the biojava-l mailing list, visit the home page
  16  * at:
  17  *
  18  *      http://www.biojava.org/
  19  *
  20  * Created on 17.10.2004
  21  * @author Andreas Prlic
  22  *
  23  */
  24
  25 package org.biojava.dasobert.das ;
  26
  27 //import org.biojava.services.das.registry.*;
  28 import org.biojava.dasobert.das.DAS_StylesheetRetrieve;
  29 import org.biojava.dasobert.dasregistry.Das1Source;
  30 import org.biojava.dasobert.dasregistry.DasCoordinateSystem;
  31 import org.biojava.dasobert.dasregistry.DasSource;
  32 import java.io.IOException                ;
  33 import java.text.DateFormat               ;
  34 import java.text.SimpleDateFormat         ;
  35 import java.util.*;
  36
  37
  38 import java.net.URL;
  39
  40 /** Manages all data about a DAS source that SPICE requires */
  41 public class SpiceDasSource
  42 extends Das1Source
  43
  44 {
  45
  46
  47     boolean status ;
  48     boolean registered ; // a flag to trace if source comes from registry or from user vonfig
  49     Map[] typeStyles;
  50     Map[] threeDstyles;
  51     public static String DEFAULT_NICKNAME = "MyDASsource";
  52     public static String DEFAULT_CAPABILITY = "features";
  53     public SpiceDasSource() {
  54         super();
  55
  56         status    = true ;  // default source is actived and used .
  57         registered = true ; // default true = source comes from registry
  58         setNickname(DEFAULT_NICKNAME);
  59         typeStyles = null;
  60         threeDstyles = null;
  61         String[] caps = new String[1];
  62         caps[0] = DEFAULT_CAPABILITY;
  63         setCapabilities(caps);
  64     }
  65
  66     public void loadStylesheet(){
  67         DAS_StylesheetRetrieve dsr = new DAS_StylesheetRetrieve();
  68         String cmd = getUrl()+"stylesheet";
  69         URL url = null;
  70         try {
  71             url = new URL(cmd);
  72         } catch (Exception e){
  73             e.printStackTrace();
  74             return ;
  75         }
  76         Map[] styles = dsr.retrieve(url);
  77
  78         if ( styles != null){
  79             typeStyles = styles;
  80         } else {
  81             typeStyles = new Map[0];
  82         }
  83
  84
  85         Map[] t3dStyles = dsr.get3DStyle();
  86         if ( t3dStyles != null){
  87             threeDstyles = t3dStyles;
  88         } else {
  89             threeDstyles = new Map[0];
  90         }
  91     }
  92
  93     /** returns the Stylesheet that is provided by a DAS source.
  94      * It provides info of how to draw a particular feature.
  95      * returns null if not attempt has been made to load the stylesheet.
  96      * afterwards it returns a Map[0] or the Map[] containing the style data.
  97      *
  98      * @return
  99      */
 100     public Map[] getStylesheet(){
 101         return typeStyles;
 102     }
 103
 104     /** get the stylesheet containing the instructions how to paint in 3D.
 105      *
 106      * @return
 107      */
 108     public Map[] get3DStylesheet(){
 109         return threeDstyles;
 110     }
 111
 112     /** a flag if this das source is active
 113      * or
 114      * @param flag
 115      */
 116     public void    setStatus(boolean flag) { status = flag ; }
 117     public boolean getStatus()             { return status ; }
 118
 119     public void    setRegistered(boolean flag) { registered = flag ; }
 120     public boolean getRegistered()             { return registered ; }
 121
 122
 123     /** convert DasSource to SpiceDasSource */
 124     public static SpiceDasSource  fromDasSource(DasSource ds) {
 125         SpiceDasSource s = new SpiceDasSource();
 126         s.setUrl(ds.getUrl());
 127         s.setAdminemail(ds.getAdminemail());
 128         s.setDescription(ds.getDescription());
 129         s.setCoordinateSystem(ds.getCoordinateSystem());
 130         s.setCapabilities(ds.getCapabilities());
 131         s.setRegisterDate(ds.getRegisterDate());
 132         s.setLeaseDate(ds.getLeaseDate());
 133         s.setNickname(ds.getNickname());
 134
 135
 136         // testcode now part of coordinate system...
 137         //s.setTestCode(ds.getTestCode());
 138         s.setId(ds.getId());
 139         s.setLabels(ds.getLabels());
 140         s.setHelperurl(ds.getHelperurl());
 141         return s;
 142     }
 143
 144
 145     public String toString() {
 146         String txt = getId()  + " " + getNickname() + " " + getUrl() ;
 147         return txt;
 148     }
 149
 150
 151 }