src/org/biojava/dasobert/feature/SegmentImpl.java

   1 /*
   2  *                  BioJava development code
   3  *
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  10  *
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  12  * authors.  These should be listed in @author doc comments.
  13  *
  14  * For more information on the BioJava project and its aims,
  15  * or to join the biojava-l mailing list, visit the home page
  16  * at:
  17  *
  18  *      http://www.biojava.org/
  19  *
  20  * Created on May 22, 2007
  21  *
  22  */
  23
  24 package org.biojava.dasobert.feature;
  25
  26 import java.awt.Color;
  27
  28 public class SegmentImpl extends AbstractSegment  {
  29
  30     public SegmentImpl() {
  31         super();
  32         start = 0 ;
  33         end   = 0 ;
  34         name  = "Unknown";
  35         color = Color.white ;
  36         txtColor = "white" ;
  37         parent = null ;
  38         note = "";
  39     }
  40
  41     public boolean equals(Segment s){
  42         if ( s == null)
  43             return false;
  44
  45         if (    ( start == s.getStart() ) &&
  46                 ( end == s.getEnd() ) &&
  47                 ( name.equals(s.getName()))
  48                 )
  49         {
  50             if ( note == null) {
  51                 if (s.getNote() == null)
  52                     return true;
  53             } else {
  54                 if (s.getNote() != null){
  55                     if (s.getNote().equals(note))
  56                         return true;
  57                 }
  58             }
  59
  60         }
  61
  62
  63         return false;
  64     }
  65
  66     public Object clone(){
  67
  68         Segment s = new SegmentImpl();
  69         s.setStart(start);
  70         s.setEnd(end);
  71         s.setName(name);
  72         s.setColor(color);
  73         s.setTxtColor(txtColor);
  74         s.setNote(note);
  75         return s;
  76
  77     }
  78 }