New schema, new objects
[jalview.git] / src / org / vamsas / objects / core / DataSetAnnotationsDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package org.vamsas.objects.core;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
18 \r
19 /**\r
20  * Class DataSetAnnotationsDescriptor.\r
21  * \r
22  * @version $Revision$ $Date$\r
23  */\r
24 public class DataSetAnnotationsDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
25 \r
26 \r
27       //--------------------------/\r
28      //- Class/Member Variables -/\r
29     //--------------------------/\r
30 \r
31     /**\r
32      * Field nsPrefix\r
33      */\r
34     private java.lang.String nsPrefix;\r
35 \r
36     /**\r
37      * Field nsURI\r
38      */\r
39     private java.lang.String nsURI;\r
40 \r
41     /**\r
42      * Field xmlName\r
43      */\r
44     private java.lang.String xmlName;\r
45 \r
46     /**\r
47      * Field identity\r
48      */\r
49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
50 \r
51 \r
52       //----------------/\r
53      //- Constructors -/\r
54     //----------------/\r
55 \r
56     public DataSetAnnotationsDescriptor() {\r
57         super();\r
58         nsURI = "http://www.vamsas.org";\r
59         xmlName = "DataSetAnnotations";\r
60         \r
61         //-- set grouping compositor\r
62         setCompositorAsSequence();\r
63         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
64         org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler              handler        = null;\r
65         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
66         //-- initialize attribute descriptors\r
67         \r
68         //-- _type\r
69         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_type", "type", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
70         desc.setImmutable(true);\r
71         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
72             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
73                 throws IllegalStateException\r
74             {\r
75                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
76                 return target.getType();\r
77             }\r
78             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
79                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
80             {\r
81                 try {\r
82                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
83                     target.setType( (java.lang.String) value);\r
84                 }\r
85                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
86                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
87                 }\r
88             }\r
89             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
90                 return null;\r
91             }\r
92         } );\r
93         desc.setHandler(handler);\r
94         desc.setRequired(true);\r
95         addFieldDescriptor(desc);\r
96         \r
97         //-- validation code for: _type\r
98         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
99         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
100         { //-- local scope\r
101             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
102             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
103             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
104         }\r
105         desc.setValidator(fieldValidator);\r
106         //-- _end\r
107         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_end", "end", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
108         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
109             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
110                 throws IllegalStateException\r
111             {\r
112                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
113                 if(!target.hasEnd())\r
114                     return null;\r
115                 return new java.lang.Integer(target.getEnd());\r
116             }\r
117             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
118                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
119             {\r
120                 try {\r
121                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
122                     // ignore null values for non optional primitives\r
123                     if (value == null) return;\r
124                     \r
125                     target.setEnd( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
126                 }\r
127                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
128                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
129                 }\r
130             }\r
131             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
132                 return null;\r
133             }\r
134         } );\r
135         desc.setHandler(handler);\r
136         desc.setRequired(true);\r
137         addFieldDescriptor(desc);\r
138         \r
139         //-- validation code for: _end\r
140         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
141         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
142         { //-- local scope\r
143             IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
144             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
145         }\r
146         desc.setValidator(fieldValidator);\r
147         //-- _begin\r
148         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Integer.TYPE, "_begin", "begin", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
149         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
150             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
151                 throws IllegalStateException\r
152             {\r
153                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
154                 if(!target.hasBegin())\r
155                     return null;\r
156                 return new java.lang.Integer(target.getBegin());\r
157             }\r
158             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
159                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
160             {\r
161                 try {\r
162                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
163                     // ignore null values for non optional primitives\r
164                     if (value == null) return;\r
165                     \r
166                     target.setBegin( ((java.lang.Integer)value).intValue());\r
167                 }\r
168                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
169                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
170                 }\r
171             }\r
172             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
173                 return null;\r
174             }\r
175         } );\r
176         desc.setHandler(handler);\r
177         desc.setRequired(true);\r
178         addFieldDescriptor(desc);\r
179         \r
180         //-- validation code for: _begin\r
181         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
182         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
183         { //-- local scope\r
184             IntegerValidator typeValidator = new IntegerValidator();\r
185             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
186         }\r
187         desc.setValidator(fieldValidator);\r
188         //-- _seqRef\r
189         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.Object.class, "_seqRef", "seqRef", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
190         desc.setReference(true);\r
191         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
192             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
193                 throws IllegalStateException\r
194             {\r
195                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
196                 return target.getSeqRef();\r
197             }\r
198             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
199                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
200             {\r
201                 try {\r
202                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
203                     target.setSeqRef( (java.lang.Object) value);\r
204                 }\r
205                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
206                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
207                 }\r
208             }\r
209             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
210                 return new java.lang.Object();\r
211             }\r
212         } );\r
213         desc.setHandler(handler);\r
214         desc.setRequired(true);\r
215         addFieldDescriptor(desc);\r
216         \r
217         //-- validation code for: _seqRef\r
218         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
219         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
220         { //-- local scope\r
221         }\r
222         desc.setValidator(fieldValidator);\r
223         //-- _id\r
224         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
225         this.identity = desc;\r
226         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
227             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
228                 throws IllegalStateException\r
229             {\r
230                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
231                 return target.getId();\r
232             }\r
233             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
234                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
235             {\r
236                 try {\r
237                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
238                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
239                 }\r
240                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
241                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
242                 }\r
243             }\r
244             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
245                 return new java.lang.String();\r
246             }\r
247         } );\r
248         desc.setHandler(handler);\r
249         addFieldDescriptor(desc);\r
250         \r
251         //-- validation code for: _id\r
252         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
253         { //-- local scope\r
254         }\r
255         desc.setValidator(fieldValidator);\r
256         //-- initialize element descriptors\r
257         \r
258         //-- _description\r
259         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_description", "description", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
260         desc.setImmutable(true);\r
261         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
262             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
263                 throws IllegalStateException\r
264             {\r
265                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
266                 return target.getDescription();\r
267             }\r
268             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
269                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
270             {\r
271                 try {\r
272                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
273                     target.setDescription( (java.lang.String) value);\r
274                 }\r
275                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
276                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
277                 }\r
278             }\r
279             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
280                 return null;\r
281             }\r
282         } );\r
283         desc.setHandler(handler);\r
284         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
285         desc.setMultivalued(false);\r
286         addFieldDescriptor(desc);\r
287         \r
288         //-- validation code for: _description\r
289         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
290         { //-- local scope\r
291             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
292             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
293             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
294         }\r
295         desc.setValidator(fieldValidator);\r
296         //-- _status\r
297         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_status", "status", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
298         desc.setImmutable(true);\r
299         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
300             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
301                 throws IllegalStateException\r
302             {\r
303                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
304                 return target.getStatus();\r
305             }\r
306             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
307                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
308             {\r
309                 try {\r
310                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
311                     target.setStatus( (java.lang.String) value);\r
312                 }\r
313                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
314                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
315                 }\r
316             }\r
317             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
318                 return null;\r
319             }\r
320         } );\r
321         desc.setHandler(handler);\r
322         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
323         desc.setMultivalued(false);\r
324         addFieldDescriptor(desc);\r
325         \r
326         //-- validation code for: _status\r
327         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
328         { //-- local scope\r
329             StringValidator typeValidator = new StringValidator();\r
330             typeValidator.setWhiteSpace("preserve");\r
331             fieldValidator.setValidator(typeValidator);\r
332         }\r
333         desc.setValidator(fieldValidator);\r
334         //-- _annotationElementList\r
335         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.AnnotationElement.class, "_annotationElementList", "annotationElement", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
336         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
337             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
338                 throws IllegalStateException\r
339             {\r
340                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
341                 return target.getAnnotationElement();\r
342             }\r
343             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
344                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
345             {\r
346                 try {\r
347                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
348                     target.addAnnotationElement( (org.vamsas.objects.core.AnnotationElement) value);\r
349                 }\r
350                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
351                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
352                 }\r
353             }\r
354             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
355                 return new org.vamsas.objects.core.AnnotationElement();\r
356             }\r
357         } );\r
358         desc.setHandler(handler);\r
359         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
360         desc.setMultivalued(true);\r
361         addFieldDescriptor(desc);\r
362         \r
363         //-- validation code for: _annotationElementList\r
364         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
365         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
366         { //-- local scope\r
367         }\r
368         desc.setValidator(fieldValidator);\r
369         //-- _provenanceList\r
370         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenanceList", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
371         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
372             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
373                 throws IllegalStateException\r
374             {\r
375                 DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
376                 return target.getProvenance();\r
377             }\r
378             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
379                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
380             {\r
381                 try {\r
382                     DataSetAnnotations target = (DataSetAnnotations) object;\r
383                     target.addProvenance( (org.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
384                 }\r
385                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
386                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
387                 }\r
388             }\r
389             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
390                 return new org.vamsas.objects.core.Provenance();\r
391             }\r
392         } );\r
393         desc.setHandler(handler);\r
394         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
395         desc.setRequired(true);\r
396         desc.setMultivalued(true);\r
397         addFieldDescriptor(desc);\r
398         \r
399         //-- validation code for: _provenanceList\r
400         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
401         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
402         { //-- local scope\r
403         }\r
404         desc.setValidator(fieldValidator);\r
405     } //-- org.vamsas.objects.core.DataSetAnnotationsDescriptor()\r
406 \r
407 \r
408       //-----------/\r
409      //- Methods -/\r
410     //-----------/\r
411 \r
412     /**\r
413      * Method getAccessMode\r
414      * \r
415      * \r
416      * \r
417      * @return AccessMode\r
418      */\r
419     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
420     {\r
421         return null;\r
422     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
423 \r
424     /**\r
425      * Method getExtends\r
426      * \r
427      * \r
428      * \r
429      * @return ClassDescriptor\r
430      */\r
431     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
432     {\r
433         return null;\r
434     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
435 \r
436     /**\r
437      * Method getIdentity\r
438      * \r
439      * \r
440      * \r
441      * @return FieldDescriptor\r
442      */\r
443     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
444     {\r
445         return identity;\r
446     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
447 \r
448     /**\r
449      * Method getJavaClass\r
450      * \r
451      * \r
452      * \r
453      * @return Class\r
454      */\r
455     public java.lang.Class getJavaClass()\r
456     {\r
457         return org.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations.class;\r
458     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
459 \r
460     /**\r
461      * Method getNameSpacePrefix\r
462      * \r
463      * \r
464      * \r
465      * @return String\r
466      */\r
467     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
468     {\r
469         return nsPrefix;\r
470     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
471 \r
472     /**\r
473      * Method getNameSpaceURI\r
474      * \r
475      * \r
476      * \r
477      * @return String\r
478      */\r
479     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
480     {\r
481         return nsURI;\r
482     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
483 \r
484     /**\r
485      * Method getValidator\r
486      * \r
487      * \r
488      * \r
489      * @return TypeValidator\r
490      */\r
491     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
492     {\r
493         return this;\r
494     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
495 \r
496     /**\r
497      * Method getXMLName\r
498      * \r
499      * \r
500      * \r
501      * @return String\r
502      */\r
503     public java.lang.String getXMLName()\r
504     {\r
505         return xmlName;\r
506     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
507 \r
508 }\r