New schema, new objects
[jalview.git] / src / org / vamsas / objects / core / DataSetDescriptor.java
1 /*\r
2  * This class was automatically generated with \r
3  * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
4  * Schema.\r
5  * $Id$\r
6  */\r
7 \r
8 package org.vamsas.objects.core;\r
9 \r
10   //---------------------------------/\r
11  //- Imported classes and packages -/\r
12 //---------------------------------/\r
13 \r
14 import org.exolab.castor.mapping.AccessMode;\r
15 import org.exolab.castor.xml.TypeValidator;\r
16 import org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor;\r
17 import org.exolab.castor.xml.validators.*;\r
18 \r
19 /**\r
20  * Class DataSetDescriptor.\r
21  * \r
22  * @version $Revision$ $Date$\r
23  */\r
24 public class DataSetDescriptor extends org.exolab.castor.xml.util.XMLClassDescriptorImpl {\r
25 \r
26 \r
27       //--------------------------/\r
28      //- Class/Member Variables -/\r
29     //--------------------------/\r
30 \r
31     /**\r
32      * Field nsPrefix\r
33      */\r
34     private java.lang.String nsPrefix;\r
35 \r
36     /**\r
37      * Field nsURI\r
38      */\r
39     private java.lang.String nsURI;\r
40 \r
41     /**\r
42      * Field xmlName\r
43      */\r
44     private java.lang.String xmlName;\r
45 \r
46     /**\r
47      * Field identity\r
48      */\r
49     private org.exolab.castor.xml.XMLFieldDescriptor identity;\r
50 \r
51 \r
52       //----------------/\r
53      //- Constructors -/\r
54     //----------------/\r
55 \r
56     public DataSetDescriptor() {\r
57         super();\r
58         nsURI = "http://www.vamsas.org";\r
59         xmlName = "DataSet";\r
60         \r
61         //-- set grouping compositor\r
62         setCompositorAsSequence();\r
63         org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl  desc           = null;\r
64         org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler              handler        = null;\r
65         org.exolab.castor.xml.FieldValidator               fieldValidator = null;\r
66         //-- initialize attribute descriptors\r
67         \r
68         //-- _id\r
69         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(java.lang.String.class, "_id", "id", org.exolab.castor.xml.NodeType.Attribute);\r
70         this.identity = desc;\r
71         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
72             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
73                 throws IllegalStateException\r
74             {\r
75                 DataSet target = (DataSet) object;\r
76                 return target.getId();\r
77             }\r
78             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
79                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
80             {\r
81                 try {\r
82                     DataSet target = (DataSet) object;\r
83                     target.setId( (java.lang.String) value);\r
84                 }\r
85                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
86                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
87                 }\r
88             }\r
89             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
90                 return new java.lang.String();\r
91             }\r
92         } );\r
93         desc.setHandler(handler);\r
94         addFieldDescriptor(desc);\r
95         \r
96         //-- validation code for: _id\r
97         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
98         { //-- local scope\r
99         }\r
100         desc.setValidator(fieldValidator);\r
101         //-- initialize element descriptors\r
102         \r
103         //-- _sequenceList\r
104         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Sequence.class, "_sequenceList", "Sequence", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
105         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
106             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
107                 throws IllegalStateException\r
108             {\r
109                 DataSet target = (DataSet) object;\r
110                 return target.getSequence();\r
111             }\r
112             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
113                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
114             {\r
115                 try {\r
116                     DataSet target = (DataSet) object;\r
117                     target.addSequence( (org.vamsas.objects.core.Sequence) value);\r
118                 }\r
119                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
120                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
121                 }\r
122             }\r
123             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
124                 return new org.vamsas.objects.core.Sequence();\r
125             }\r
126         } );\r
127         desc.setHandler(handler);\r
128         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
129         desc.setRequired(true);\r
130         desc.setMultivalued(true);\r
131         addFieldDescriptor(desc);\r
132         \r
133         //-- validation code for: _sequenceList\r
134         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
135         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
136         { //-- local scope\r
137         }\r
138         desc.setValidator(fieldValidator);\r
139         //-- _dataSetAnnotationsList\r
140         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations.class, "_dataSetAnnotationsList", "DataSetAnnotations", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
141         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
142             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
143                 throws IllegalStateException\r
144             {\r
145                 DataSet target = (DataSet) object;\r
146                 return target.getDataSetAnnotations();\r
147             }\r
148             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
149                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
150             {\r
151                 try {\r
152                     DataSet target = (DataSet) object;\r
153                     target.addDataSetAnnotations( (org.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations) value);\r
154                 }\r
155                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
156                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
157                 }\r
158             }\r
159             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
160                 return new org.vamsas.objects.core.DataSetAnnotations();\r
161             }\r
162         } );\r
163         desc.setHandler(handler);\r
164         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
165         desc.setMultivalued(true);\r
166         addFieldDescriptor(desc);\r
167         \r
168         //-- validation code for: _dataSetAnnotationsList\r
169         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
170         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
171         { //-- local scope\r
172         }\r
173         desc.setValidator(fieldValidator);\r
174         //-- _alignmentList\r
175         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Alignment.class, "_alignmentList", "Alignment", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
176         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
177             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
178                 throws IllegalStateException\r
179             {\r
180                 DataSet target = (DataSet) object;\r
181                 return target.getAlignment();\r
182             }\r
183             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
184                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
185             {\r
186                 try {\r
187                     DataSet target = (DataSet) object;\r
188                     target.addAlignment( (org.vamsas.objects.core.Alignment) value);\r
189                 }\r
190                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
191                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
192                 }\r
193             }\r
194             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
195                 return new org.vamsas.objects.core.Alignment();\r
196             }\r
197         } );\r
198         desc.setHandler(handler);\r
199         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
200         desc.setMultivalued(true);\r
201         addFieldDescriptor(desc);\r
202         \r
203         //-- validation code for: _alignmentList\r
204         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
205         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
206         { //-- local scope\r
207         }\r
208         desc.setValidator(fieldValidator);\r
209         //-- _treeList\r
210         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Tree.class, "_treeList", "Tree", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
211         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
212             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
213                 throws IllegalStateException\r
214             {\r
215                 DataSet target = (DataSet) object;\r
216                 return target.getTree();\r
217             }\r
218             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
219                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
220             {\r
221                 try {\r
222                     DataSet target = (DataSet) object;\r
223                     target.addTree( (org.vamsas.objects.core.Tree) value);\r
224                 }\r
225                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
226                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
227                 }\r
228             }\r
229             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
230                 return new org.vamsas.objects.core.Tree();\r
231             }\r
232         } );\r
233         desc.setHandler(handler);\r
234         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
235         desc.setMultivalued(true);\r
236         addFieldDescriptor(desc);\r
237         \r
238         //-- validation code for: _treeList\r
239         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
240         fieldValidator.setMinOccurs(0);\r
241         { //-- local scope\r
242         }\r
243         desc.setValidator(fieldValidator);\r
244         //-- _provenance\r
245         desc = new org.exolab.castor.xml.util.XMLFieldDescriptorImpl(org.vamsas.objects.core.Provenance.class, "_provenance", "Provenance", org.exolab.castor.xml.NodeType.Element);\r
246         handler = (new org.exolab.castor.xml.XMLFieldHandler() {\r
247             public java.lang.Object getValue( java.lang.Object object ) \r
248                 throws IllegalStateException\r
249             {\r
250                 DataSet target = (DataSet) object;\r
251                 return target.getProvenance();\r
252             }\r
253             public void setValue( java.lang.Object object, java.lang.Object value) \r
254                 throws IllegalStateException, IllegalArgumentException\r
255             {\r
256                 try {\r
257                     DataSet target = (DataSet) object;\r
258                     target.setProvenance( (org.vamsas.objects.core.Provenance) value);\r
259                 }\r
260                 catch (java.lang.Exception ex) {\r
261                     throw new IllegalStateException(ex.toString());\r
262                 }\r
263             }\r
264             public java.lang.Object newInstance( java.lang.Object parent ) {\r
265                 return new org.vamsas.objects.core.Provenance();\r
266             }\r
267         } );\r
268         desc.setHandler(handler);\r
269         desc.setNameSpaceURI("http://www.vamsas.org");\r
270         desc.setRequired(true);\r
271         desc.setMultivalued(false);\r
272         addFieldDescriptor(desc);\r
273         \r
274         //-- validation code for: _provenance\r
275         fieldValidator = new org.exolab.castor.xml.FieldValidator();\r
276         fieldValidator.setMinOccurs(1);\r
277         { //-- local scope\r
278         }\r
279         desc.setValidator(fieldValidator);\r
280     } //-- org.vamsas.objects.core.DataSetDescriptor()\r
281 \r
282 \r
283       //-----------/\r
284      //- Methods -/\r
285     //-----------/\r
286 \r
287     /**\r
288      * Method getAccessMode\r
289      * \r
290      * \r
291      * \r
292      * @return AccessMode\r
293      */\r
294     public org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode()\r
295     {\r
296         return null;\r
297     } //-- org.exolab.castor.mapping.AccessMode getAccessMode() \r
298 \r
299     /**\r
300      * Method getExtends\r
301      * \r
302      * \r
303      * \r
304      * @return ClassDescriptor\r
305      */\r
306     public org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends()\r
307     {\r
308         return null;\r
309     } //-- org.exolab.castor.mapping.ClassDescriptor getExtends() \r
310 \r
311     /**\r
312      * Method getIdentity\r
313      * \r
314      * \r
315      * \r
316      * @return FieldDescriptor\r
317      */\r
318     public org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity()\r
319     {\r
320         return identity;\r
321     } //-- org.exolab.castor.mapping.FieldDescriptor getIdentity() \r
322 \r
323     /**\r
324      * Method getJavaClass\r
325      * \r
326      * \r
327      * \r
328      * @return Class\r
329      */\r
330     public java.lang.Class getJavaClass()\r
331     {\r
332         return org.vamsas.objects.core.DataSet.class;\r
333     } //-- java.lang.Class getJavaClass() \r
334 \r
335     /**\r
336      * Method getNameSpacePrefix\r
337      * \r
338      * \r
339      * \r
340      * @return String\r
341      */\r
342     public java.lang.String getNameSpacePrefix()\r
343     {\r
344         return nsPrefix;\r
345     } //-- java.lang.String getNameSpacePrefix() \r
346 \r
347     /**\r
348      * Method getNameSpaceURI\r
349      * \r
350      * \r
351      * \r
352      * @return String\r
353      */\r
354     public java.lang.String getNameSpaceURI()\r
355     {\r
356         return nsURI;\r
357     } //-- java.lang.String getNameSpaceURI() \r
358 \r
359     /**\r
360      * Method getValidator\r
361      * \r
362      * \r
363      * \r
364      * @return TypeValidator\r
365      */\r
366     public org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator()\r
367     {\r
368         return this;\r
369     } //-- org.exolab.castor.xml.TypeValidator getValidator() \r
370 \r
371     /**\r
372      * Method getXMLName\r
373      * \r
374      * \r
375      * \r
376      * @return String\r
377      */\r
378     public java.lang.String getXMLName()\r
379     {\r
380         return xmlName;\r
381     } //-- java.lang.String getXMLName() \r
382 \r
383 }\r