src/uk/ac/ebi/picr/model/UPEntry.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Development Version 2.4.1)\r
   3  * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  * \r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  * \r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 package uk.ac.ebi.picr.model;\r
  20 \r
  21 public class UPEntry implements java.io.Serializable\r
  22 {\r
  23   private java.lang.String CRC64;\r
  24 \r
  25   private java.lang.String UPI;\r
  26 \r
  27   private uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences;\r
  28 \r
  29   private uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences;\r
  30 \r
  31   private java.lang.String sequence;\r
  32 \r
  33   private java.util.Calendar timestamp;\r
  34 \r
  35   public UPEntry()\r
  36   {\r
  37   }\r
  38 \r
  39   public UPEntry(java.lang.String CRC64, java.lang.String UPI,\r
  40           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences,\r
  41           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences,\r
  42           java.lang.String sequence, java.util.Calendar timestamp)\r
  43   {\r
  44     this.CRC64 = CRC64;\r
  45     this.UPI = UPI;\r
  46     this.identicalCrossReferences = identicalCrossReferences;\r
  47     this.logicalCrossReferences = logicalCrossReferences;\r
  48     this.sequence = sequence;\r
  49     this.timestamp = timestamp;\r
  50   }\r
  51 \r
  52   /**\r
  53    * Gets the CRC64 value for this UPEntry.\r
  54    * \r
  55    * @return CRC64\r
  56    */\r
  57   public java.lang.String getCRC64()\r
  58   {\r
  59     return CRC64;\r
  60   }\r
  61 \r
  62   /**\r
  63    * Sets the CRC64 value for this UPEntry.\r
  64    * \r
  65    * @param CRC64\r
  66    */\r
  67   public void setCRC64(java.lang.String CRC64)\r
  68   {\r
  69     this.CRC64 = CRC64;\r
  70   }\r
  71 \r
  72   /**\r
  73    * Gets the UPI value for this UPEntry.\r
  74    * \r
  75    * @return UPI\r
  76    */\r
  77   public java.lang.String getUPI()\r
  78   {\r
  79     return UPI;\r
  80   }\r
  81 \r
  82   /**\r
  83    * Sets the UPI value for this UPEntry.\r
  84    * \r
  85    * @param UPI\r
  86    */\r
  87   public void setUPI(java.lang.String UPI)\r
  88   {\r
  89     this.UPI = UPI;\r
  90   }\r
  91 \r
  92   /**\r
  93    * Gets the identicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
  94    * \r
  95    * @return identicalCrossReferences\r
  96    */\r
  97   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] getIdenticalCrossReferences()\r
  98   {\r
  99     return identicalCrossReferences;\r
 100   }\r
 101 \r
 102   /**\r
 103    * Sets the identicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 104    * \r
 105    * @param identicalCrossReferences\r
 106    */\r
 107   public void setIdenticalCrossReferences(\r
 108           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] identicalCrossReferences)\r
 109   {\r
 110     this.identicalCrossReferences = identicalCrossReferences;\r
 111   }\r
 112 \r
 113   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference getIdenticalCrossReferences(\r
 114           int i)\r
 115   {\r
 116     return this.identicalCrossReferences[i];\r
 117   }\r
 118 \r
 119   public void setIdenticalCrossReferences(int i,\r
 120           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference _value)\r
 121   {\r
 122     this.identicalCrossReferences[i] = _value;\r
 123   }\r
 124 \r
 125   /**\r
 126    * Gets the logicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 127    * \r
 128    * @return logicalCrossReferences\r
 129    */\r
 130   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] getLogicalCrossReferences()\r
 131   {\r
 132     return logicalCrossReferences;\r
 133   }\r
 134 \r
 135   /**\r
 136    * Sets the logicalCrossReferences value for this UPEntry.\r
 137    * \r
 138    * @param logicalCrossReferences\r
 139    */\r
 140   public void setLogicalCrossReferences(\r
 141           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference[] logicalCrossReferences)\r
 142   {\r
 143     this.logicalCrossReferences = logicalCrossReferences;\r
 144   }\r
 145 \r
 146   public uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference getLogicalCrossReferences(int i)\r
 147   {\r
 148     return this.logicalCrossReferences[i];\r
 149   }\r
 150 \r
 151   public void setLogicalCrossReferences(int i,\r
 152           uk.ac.ebi.picr.model.CrossReference _value)\r
 153   {\r
 154     this.logicalCrossReferences[i] = _value;\r
 155   }\r
 156 \r
 157   /**\r
 158    * Gets the sequence value for this UPEntry.\r
 159    * \r
 160    * @return sequence\r
 161    */\r
 162   public java.lang.String getSequence()\r
 163   {\r
 164     return sequence;\r
 165   }\r
 166 \r
 167   /**\r
 168    * Sets the sequence value for this UPEntry.\r
 169    * \r
 170    * @param sequence\r
 171    */\r
 172   public void setSequence(java.lang.String sequence)\r
 173   {\r
 174     this.sequence = sequence;\r
 175   }\r
 176 \r
 177   /**\r
 178    * Gets the timestamp value for this UPEntry.\r
 179    * \r
 180    * @return timestamp\r
 181    */\r
 182   public java.util.Calendar getTimestamp()\r
 183   {\r
 184     return timestamp;\r
 185   }\r
 186 \r
 187   /**\r
 188    * Sets the timestamp value for this UPEntry.\r
 189    * \r
 190    * @param timestamp\r
 191    */\r
 192   public void setTimestamp(java.util.Calendar timestamp)\r
 193   {\r
 194     this.timestamp = timestamp;\r
 195   }\r
 196 \r
 197   private java.lang.Object __equalsCalc = null;\r
 198 \r
 199   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)\r
 200   {\r
 201     if (!(obj instanceof UPEntry))\r
 202       return false;\r
 203     UPEntry other = (UPEntry) obj;\r
 204     if (obj == null)\r
 205       return false;\r
 206     if (this == obj)\r
 207       return true;\r
 208     if (__equalsCalc != null)\r
 209     {\r
 210       return (__equalsCalc == obj);\r
 211     }\r
 212     __equalsCalc = obj;\r
 213     boolean _equals;\r
 214     _equals = true\r
 215             && ((this.CRC64 == null && other.getCRC64() == null) || (this.CRC64 != null && this.CRC64\r
 216                     .equals(other.getCRC64())))\r
 217             && ((this.UPI == null && other.getUPI() == null) || (this.UPI != null && this.UPI\r
 218                     .equals(other.getUPI())))\r
 219             && ((this.identicalCrossReferences == null && other\r
 220                     .getIdenticalCrossReferences() == null) || (this.identicalCrossReferences != null && java.util.Arrays\r
 221                     .equals(this.identicalCrossReferences, other\r
 222                             .getIdenticalCrossReferences())))\r
 223             && ((this.logicalCrossReferences == null && other\r
 224                     .getLogicalCrossReferences() == null) || (this.logicalCrossReferences != null && java.util.Arrays\r
 225                     .equals(this.logicalCrossReferences, other\r
 226                             .getLogicalCrossReferences())))\r
 227             && ((this.sequence == null && other.getSequence() == null) || (this.sequence != null && this.sequence\r
 228                     .equals(other.getSequence())))\r
 229             && ((this.timestamp == null && other.getTimestamp() == null) || (this.timestamp != null && this.timestamp\r
 230                     .equals(other.getTimestamp())));\r
 231     __equalsCalc = null;\r
 232     return _equals;\r
 233   }\r
 234 \r
 235   private boolean __hashCodeCalc = false;\r
 236 \r
 237   public synchronized int hashCode()\r
 238   {\r
 239     if (__hashCodeCalc)\r
 240     {\r
 241       return 0;\r
 242     }\r
 243     __hashCodeCalc = true;\r
 244     int _hashCode = 1;\r
 245     if (getCRC64() != null)\r
 246     {\r
 247       _hashCode += getCRC64().hashCode();\r
 248     }\r
 249     if (getUPI() != null)\r
 250     {\r
 251       _hashCode += getUPI().hashCode();\r
 252     }\r
 253     if (getIdenticalCrossReferences() != null)\r
 254     {\r
 255       for (int i = 0; i < java.lang.reflect.Array\r
 256               .getLength(getIdenticalCrossReferences()); i++)\r
 257       {\r
 258         java.lang.Object obj = java.lang.reflect.Array.get(\r
 259                 getIdenticalCrossReferences(), i);\r
 260         if (obj != null && !obj.getClass().isArray())\r
 261         {\r
 262           _hashCode += obj.hashCode();\r
 263         }\r
 264       }\r
 265     }\r
 266     if (getLogicalCrossReferences() != null)\r
 267     {\r
 268       for (int i = 0; i < java.lang.reflect.Array\r
 269               .getLength(getLogicalCrossReferences()); i++)\r
 270       {\r
 271         java.lang.Object obj = java.lang.reflect.Array.get(\r
 272                 getLogicalCrossReferences(), i);\r
 273         if (obj != null && !obj.getClass().isArray())\r
 274         {\r
 275           _hashCode += obj.hashCode();\r
 276         }\r
 277       }\r
 278     }\r
 279     if (getSequence() != null)\r
 280     {\r
 281       _hashCode += getSequence().hashCode();\r
 282     }\r
 283     if (getTimestamp() != null)\r
 284     {\r
 285       _hashCode += getTimestamp().hashCode();\r
 286     }\r
 287     __hashCodeCalc = false;\r
 288     return _hashCode;\r
 289   }\r
 290 \r
 291 }\r