(JAL-965) new api methods to allow features to be loaded without automatically enabli...
[jalview.git] / src / uk / ac / ebi / www / picr / AccessionMappingService / AccessionMapperInterface.java
1 /*\r
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
4  * \r
5  * This file is part of Jalview.\r
6  * \r
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
10  * \r
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
15  * \r
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
17  */\r
18 package uk.ac.ebi.www.picr.AccessionMappingService;\r
19 \r
20 public interface AccessionMapperInterface extends java.rmi.Remote\r
21 {\r
22   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry getUPIForSequence(\r
23           java.lang.String sequence, java.lang.String[] searchDatabases,\r
24           java.lang.String taxonId, boolean onlyActive)\r
25           throws java.rmi.RemoteException;\r
26 \r
27   public uk.ac.ebi.picr.model.UPEntry[] getUPIForAccession(\r
28           java.lang.String accession, java.lang.String ac_version,\r
29           java.lang.String[] searchDatabases, java.lang.String taxonId,\r
30           boolean onlyActive) throws java.rmi.RemoteException;\r
31 \r
32   public java.lang.String[] getMappedDatabaseNames()\r
33           throws java.rmi.RemoteException;\r
34 }\r