JAL-1136 give pre-existing custom settings a special name when job parameter settings...
[jalview.git] / src / vamsas / objects / simple / MsaResult_Helper.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
10  * 
11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17  */
18 /*
19  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer
20  * Copyright (C) 2007 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
21  *
22  * This program is free software; you can redistribute it and/or
23  * modify it under the terms of the GNU General Public License
24  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
25  * of the License, or (at your option) any later version.
26  *
27  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
28  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
29  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
30  * GNU General Public License for more details.
31  *
32  * You should have received a copy of the GNU General Public License
33  * along with this program; if not, write to the Free Software
34  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
35  */
36 package vamsas.objects.simple;
37
38 public class MsaResult_Helper
39 {
40   // Type metadata
41   private static org.apache.axis.description.TypeDesc typeDesc = new org.apache.axis.description.TypeDesc(
42           MsaResult.class, true);
43
44   static
45   {
46     typeDesc.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
47             "simple.objects.vamsas", "MsaResult"));
48
49     org.apache.axis.description.ElementDesc elemField = new org.apache.axis.description.ElementDesc();
50     elemField.setFieldName("msa");
51     elemField.setXmlName(new javax.xml.namespace.QName("", "msa"));
52     elemField.setXmlType(new javax.xml.namespace.QName(
53             "simple.objects.vamsas", "Alignment"));
54     typeDesc.addFieldDesc(elemField);
55   }
56
57   /**
58    * Return type metadata object
59    */
60   public static org.apache.axis.description.TypeDesc getTypeDesc()
61   {
62     return typeDesc;
63   }
64
65   /**
66    * Get Custom Serializer
67    */
68   public static org.apache.axis.encoding.Serializer getSerializer(
69           java.lang.String mechType, java.lang.Class _javaType,
70           javax.xml.namespace.QName _xmlType)
71   {
72     return new org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializer(_javaType,
73             _xmlType, typeDesc);
74   }
75
76   /**
77    * Get Custom Deserializer
78    */
79   public static org.apache.axis.encoding.Deserializer getDeserializer(
80           java.lang.String mechType, java.lang.Class _javaType,
81           javax.xml.namespace.QName _xmlType)
82   {
83     return new org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializer(_javaType,
84             _xmlType, typeDesc);
85   }
86 }