src/vamsas/objects/simple/Sequence.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4)
   3  * Copyright (C) 2008 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
   8  * of the License, or (at your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  13  * GNU General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA
  18  */
  19 package vamsas.objects.simple;
  20
  21 public class Sequence implements java.io.Serializable
  22 {
  23   private java.lang.String id;
  24
  25   private java.lang.String seq;
  26
  27   public Sequence()
  28   {
  29   }
  30
  31   public Sequence(java.lang.String id, java.lang.String seq)
  32   {
  33     this.id = id;
  34     this.seq = seq;
  35   }
  36
  37   /**
  38    * Gets the id value for this Sequence.
  39    *
  40    * @return id
  41    */
  42   public java.lang.String getId()
  43   {
  44     return id;
  45   }
  46
  47   /**
  48    * Sets the id value for this Sequence.
  49    *
  50    * @param id
  51    */
  52   public void setId(java.lang.String id)
  53   {
  54     this.id = id;
  55   }
  56
  57   /**
  58    * Gets the seq value for this Sequence.
  59    *
  60    * @return seq
  61    */
  62   public java.lang.String getSeq()
  63   {
  64     return seq;
  65   }
  66
  67   /**
  68    * Sets the seq value for this Sequence.
  69    *
  70    * @param seq
  71    */
  72   public void setSeq(java.lang.String seq)
  73   {
  74     this.seq = seq;
  75   }
  76
  77   private java.lang.Object __equalsCalc = null;
  78
  79   public synchronized boolean equals(java.lang.Object obj)
  80   {
  81     if (!(obj instanceof Sequence))
  82       return false;
  83     Sequence other = (Sequence) obj;
  84     if (obj == null)
  85       return false;
  86     if (this == obj)
  87       return true;
  88     if (__equalsCalc != null)
  89     {
  90       return (__equalsCalc == obj);
  91     }
  92     __equalsCalc = obj;
  93     boolean _equals;
  94     _equals = true
  95             && ((this.id == null && other.getId() == null) || (this.id != null && this.id
  96                     .equals(other.getId())))
  97             && ((this.seq == null && other.getSeq() == null) || (this.seq != null && this.seq
  98                     .equals(other.getSeq())));
  99     __equalsCalc = null;
 100     return _equals;
 101   }
 102
 103   private boolean __hashCodeCalc = false;
 104
 105   public synchronized int hashCode()
 106   {
 107     if (__hashCodeCalc)
 108     {
 109       return 0;
 110     }
 111     __hashCodeCalc = true;
 112     int _hashCode = 1;
 113     if (getId() != null)
 114     {
 115       _hashCode += getId().hashCode();
 116     }
 117     if (getSeq() != null)
 118     {
 119       _hashCode += getSeq().hashCode();
 120     }
 121     __hashCodeCalc = false;
 122     return _hashCode;
 123   }
 124
 125 }