test/jalview/bin/ArgParserTest.java

   1 package jalview.bin;
   2
   3 import java.io.File;
   4 import java.io.IOException;
   5 import java.util.List;
   6 import java.util.Properties;
   7
   8 import org.testng.Assert;
   9 import org.testng.annotations.DataProvider;
  10 import org.testng.annotations.Test;
  11
  12 import jalview.bin.ArgParser.Arg;
  13 import jalview.bin.ArgParser.BootstrapArgs;
  14 import jalview.util.FileUtils;
  15
  16 public class ArgParserTest
  17 {
  18
  19   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argLines")
  20   public void parseArgsAndSubValsTest(String commandLineArgs)
  21   {
  22     String[] args = commandLineArgs.split("\\s*");
  23     ArgParser argparser = new ArgParser(args);
  24   }
  25
  26   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argLines")
  27   public void bootstrapArgsTest(String commandLineArgs, Arg a, String other)
  28   {
  29     String[] args = commandLineArgs.split("\\s+");
  30     BootstrapArgs b = BootstrapArgs.getBootstrapArgs(args);
  31
  32     Assert.assertTrue(b.contains(a));
  33     if (a == Arg.PROPS)
  34     {
  35       Properties bP = Cache.bootstrapProperties(b.get(Arg.PROPS));
  36       Assert.assertTrue(other.equals(bP.get(Cache.BOOTSTRAP_TEST)));
  37     }
  38     else if (a == Arg.ARGFILE)
  39     {
  40       List<File> files = FileUtils.getFilesFromGlob(b.get(a));
  41       boolean found = false;
  42       for (File f : files)
  43       {
  44         File fo = new File(other);
  45         try
  46         {
  47           if (fo.getCanonicalPath().equals(f.getCanonicalPath()))
  48           {
  49             found = true;
  50             break;
  51           }
  52         } catch (IOException e)
  53         {
  54         }
  55       }
  56       Assert.assertTrue(found);
  57     }
  58
  59   }
  60
  61   @Test(groups = "Functional", dataProvider = "argFiles")
  62   public void argFilesTest(String commandLineArgs, Arg a)
  63   {
  64     String[] args = commandLineArgs.split("\\s+");
  65     BootstrapArgs b = BootstrapArgs.getBootstrapArgs(args);
  66
  67     Assert.assertTrue(b.contains(a));
  68     if (a == Arg.PROPS)
  69     {
  70       Properties bP = Cache.bootstrapProperties(b.get(Arg.PROPS));
  71       Assert.assertTrue("true".equals(bP.get(Cache.BOOTSTRAP_TEST)));
  72     }
  73
  74   }
  75
  76   @DataProvider(name = "argLines")
  77   public Object[][] argLines()
  78   {
  79     return new Object[][] {
  80         { "--debug --open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa", Arg.DEBUG,
  81             null },
  82         { "--open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa --headless",
  83             Arg.HEADLESS, null },
  84         { "--open=test/jalview/bin/argparser/test1.fa --props=test/jalview/bin/argparser/testProps.jvprops",
  85             Arg.PROPS, "true" },
  86         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile*.txt", Arg.ARGFILE,
  87             "test/jalview/bin/argparser/argfile1.txt" } };
  88   }
  89
  90   @DataProvider(name = "argFiles")
  91   public Object[][] argFiles()
  92   {
  93     return new Object[][] {
  94         { "--argfile=test/jalview/bin/argparser/argfile0.txt", Arg.OPEN,
  95             "test/jalview/bin/argfiles/test1.fa" } };
  96   }
  97 }