JAL-4091 JAL-629 ‘Add Reference Annotations’ takes description into account when...
[jalview.git] / test / jalview / datamodel / HiddenColumnsCursorTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.datamodel;
22
23 import static org.testng.Assert.assertNull;
24 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
25
26 import java.util.ArrayList;
27 import java.util.List;
28
29 import org.testng.annotations.Test;
30
31 public class HiddenColumnsCursorTest
32 {
33
34   @Test(groups = { "Functional" })
35   public void testConstructor()
36   {
37     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
38     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
39
40     List<int[]> hlist = new ArrayList<>();
41     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist);
42     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
43
44     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist, 3, 12);
45     assertNull(cursor.findRegionForColumn(0, false));
46
47     hlist.add(new int[] { 3, 7 });
48     hlist.add(new int[] { 15, 25 });
49     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist);
50     HiddenCursorPosition p = cursor.findRegionForColumn(8, false);
51     assertEquals(1, p.getRegionIndex());
52
53     cursor = new HiddenColumnsCursor(hlist, 1, 5);
54     p = cursor.findRegionForColumn(8, false);
55     assertEquals(1, p.getRegionIndex());
56   }
57
58   /**
59    * Test the method which finds the corresponding region given a column
60    */
61   @Test(groups = { "Functional" })
62   public void testFindRegionForColumn()
63   {
64     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
65
66     HiddenCursorPosition pos = cursor.findRegionForColumn(20, false);
67     assertNull(pos);
68
69     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
70     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
71     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
72
73     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
74
75     int regionIndex = cursor.findRegionForColumn(126, false)
76             .getRegionIndex();
77     assertEquals(2, regionIndex);
78
79     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(125, false).getRegionIndex();
80     assertEquals(1, regionIndex);
81
82     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(108, false).getRegionIndex();
83     assertEquals(1, regionIndex);
84
85     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(104, false).getRegionIndex();
86     assertEquals(1, regionIndex);
87
88     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(103, false).getRegionIndex();
89     assertEquals(1, regionIndex);
90
91     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(77, false).getRegionIndex();
92     assertEquals(1, regionIndex);
93
94     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(76, false).getRegionIndex();
95     assertEquals(0, regionIndex);
96
97     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(53, false).getRegionIndex();
98     assertEquals(0, regionIndex);
99
100     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(52, false).getRegionIndex();
101     assertEquals(0, regionIndex);
102
103     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(0, false).getRegionIndex();
104     assertEquals(0, regionIndex);
105
106     hidden.add(new int[] { 138, 155 });
107
108     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
109
110     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(160, false).getRegionIndex();
111     assertEquals(3, regionIndex);
112
113     regionIndex = cursor.findRegionForColumn(100, false).getRegionIndex();
114     assertEquals(1, regionIndex);
115   }
116
117   /**
118    * Test the method which counts the number of hidden columns before a column
119    */
120   @Test(groups = { "Functional" })
121   public void testFindRegionForColumn_Visible()
122   {
123     HiddenColumnsCursor cursor = new HiddenColumnsCursor();
124
125     HiddenCursorPosition pos = cursor.findRegionForColumn(20, true);
126     assertNull(pos);
127
128     List<int[]> hidden = new ArrayList<>();
129     hidden.add(new int[] { 53, 76 });
130     hidden.add(new int[] { 104, 125 });
131
132     cursor = new HiddenColumnsCursor(hidden);
133
134     int offset = cursor.findRegionForColumn(80, true).getHiddenSoFar();
135     assertEquals(46, offset);
136
137     offset = cursor.findRegionForColumn(79, true).getHiddenSoFar();
138     assertEquals(24, offset);
139
140     offset = cursor.findRegionForColumn(53, true).getHiddenSoFar();
141     assertEquals(24, offset);
142
143     offset = cursor.findRegionForColumn(52, true).getHiddenSoFar();
144     assertEquals(0, offset);
145
146     offset = cursor.findRegionForColumn(10, true).getHiddenSoFar();
147     assertEquals(0, offset);
148
149     offset = cursor.findRegionForColumn(0, true).getHiddenSoFar();
150     assertEquals(0, offset);
151
152     offset = cursor.findRegionForColumn(79, true).getHiddenSoFar();
153     assertEquals(24, offset);
154
155     offset = cursor.findRegionForColumn(80, true).getHiddenSoFar();
156     assertEquals(46, offset);
157   }
158 }