test/jalview/datamodel/xdb/embl/EmblEntryTest.java

   1 package jalview.datamodel.xdb.embl;
   2
   3 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
   4
   5 import java.util.Arrays;
   6
   7 import org.testng.annotations.Test;
   8
   9 public class EmblEntryTest
  10 {
  11   @Test(groups = "Functional")
  12   public void testGetCdsRanges()
  13   {
  14     EmblEntry testee = new EmblEntry();
  15
  16     /*
  17      * Make a (CDS) Feature with 4 locations
  18      */
  19     EmblFeature cds = new EmblFeature();
  20     cds.setLocation("join(10..20,complement(30..40),50..60,70..80,complement(110..120))");
  21
  22     int[] exons = testee.getCdsRanges(cds);
  23     assertEquals("[10, 20, 40, 30, 50, 60, 70, 80, 120, 110]",
  24             Arrays.toString(exons));
  25   }
  26 }