test/jalview/ext/ensembl/EnsemblRestClientTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.ext.ensembl;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertTrue;
  24
  25 import jalview.datamodel.AlignmentI;
  26
  27 import java.net.MalformedURLException;
  28 import java.net.URL;
  29 import java.util.List;
  30
  31 import org.testng.annotations.BeforeMethod;
  32 import org.testng.annotations.Test;
  33
  34 public class EnsemblRestClientTest
  35 {
  36   private EnsemblRestClient sf;
  37
  38   @Test(suiteName = "live")
  39   public void testIsEnsemblAvailable()
  40   {
  41     boolean isAvailable = sf.isEnsemblAvailable();
  42     if (isAvailable)
  43     {
  44       System.out.println("Ensembl is UP!");
  45     }
  46     else
  47     {
  48       System.err
  49               .println("Ensembl is DOWN or unreachable ******************* BAD!");
  50     }
  51   }
  52
  53   @BeforeMethod(alwaysRun = true)
  54   protected void setUp()
  55   {
  56     sf = new EnsemblRestClient()
  57     {
  58
  59       @Override
  60       public String getDbName()
  61       {
  62         return null;
  63       }
  64
  65       @Override
  66       public AlignmentI getSequenceRecords(String queries) throws Exception
  67       {
  68         return null;
  69       }
  70
  71       @Override
  72       protected URL getUrl(List<String> ids) throws MalformedURLException
  73       {
  74         return null;
  75       }
  76
  77       @Override
  78       protected boolean useGetRequest()
  79       {
  80         return false;
  81       }
  82     };
  83   }
  84
  85   @Test(groups = "Network")
  86   public void testCheckEnsembl_overload()
  87   {
  88     for (int i = 0; i < 20; i++)
  89     {
  90       assertTrue(sf.checkEnsembl(), "Error on " + (i + 1) + "th ping");
  91     }
  92   }
  93 }