JAL-3783 Reverting to using groovy-all-2.4.12-indy.jar to fix serious problem with...
[jalview.git] / test / jalview / ext / ensembl / EnsemblSeqProxyAdapter.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.ext.ensembl;
22
23 import jalview.datamodel.SequenceFeature;
24 import jalview.datamodel.SequenceI;
25
26 import java.util.ArrayList;
27 import java.util.List;
28
29 /**
30  * A convenience class to simplify writing unit tests (pending Mockito or
31  * similar?)
32  */
33 public class EnsemblSeqProxyAdapter extends EnsemblSeqProxy
34 {
35   /**
36    * Default constructor (to use rest.ensembl.org)
37    */
38   public EnsemblSeqProxyAdapter()
39   {
40     super();
41   }
42
43   /**
44    * Constructor given the target domain to fetch data from
45    * 
46    * @param d
47    */
48   public EnsemblSeqProxyAdapter(String d)
49   {
50     super(d);
51   }
52
53   @Override
54   public String getDbName()
55   {
56     return null;
57   }
58
59   @Override
60   protected EnsemblFeatureType[] getFeaturesToFetch()
61   {
62     return null;
63   }
64
65   @Override
66   protected EnsemblSeqType getSourceEnsemblType()
67   {
68     return null;
69   }
70
71   @Override
72   protected List<SequenceFeature> getIdentifyingFeatures(SequenceI seq,
73           String accId)
74   {
75     return new ArrayList<>();
76   }
77
78 }