test/jalview/gui/AppVarnaTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
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   4  *
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  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.gui;
  22
  23 import static org.testng.AssertJUnit.assertEquals;
  24 import static org.testng.AssertJUnit.assertNull;
  25 import static org.testng.AssertJUnit.assertSame;
  26
  27 import org.testng.annotations.BeforeClass;
  28 import org.testng.annotations.Test;
  29
  30 public class AppVarnaTest
  31 {
  32
  33   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  34   public void setUpJvOptionPane()
  35   {
  36     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
  37     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
  38   }
  39
  40   @Test(groups = "Functional")
  41   public void testReplaceOddGaps()
  42   {
  43     String struct = "{(<]}>)";
  44     String replaced = AppVarna.replaceOddGaps(struct);
  45     assertEquals(struct, replaced);
  46     assertSame(struct, replaced);
  47     assertEquals("..{.([.<.].}.>)",
  48             AppVarna.replaceOddGaps("..{ ([*<-]?} >)"));
  49     assertEquals("....", AppVarna.replaceOddGaps("cgta"));
  50     assertEquals("", AppVarna.replaceOddGaps(""));
  51     assertNull(AppVarna.replaceOddGaps(null));
  52   }
  53 }