test/jalview/gui/StructureViewerTest.java

   1 package jalview.gui;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertNull;
   5
   6 import jalview.datamodel.PDBEntry;
   7 import jalview.datamodel.PDBEntry.Type;
   8
   9 import org.testng.annotations.BeforeClass;
  10 import org.testng.annotations.Test;
  11
  12 public class StructureViewerTest
  13 {
  14
  15   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  16   public void setUpJvOptionPane()
  17   {
  18     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
  19     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
  20   }
  21
  22   @Test(groups = "Functional")
  23   public void testGetUniquePdbFiles()
  24   {
  25     assertNull(StructureViewer.getUniquePdbFiles(null));
  26
  27     PDBEntry pdbe1 = new PDBEntry("1A70", "A", Type.PDB, "path1");
  28     PDBEntry pdbe2 = new PDBEntry("3A6S", "A", Type.PDB, "path2");
  29     PDBEntry pdbe3 = new PDBEntry("1A70", "B", Type.PDB, "path1");
  30     PDBEntry pdbe4 = new PDBEntry("1GAQ", "A", Type.PDB, null);
  31     PDBEntry pdbe5 = new PDBEntry("3A6S", "B", Type.PDB, "path2");
  32     PDBEntry pdbe6 = new PDBEntry("1GAQ", "B", Type.PDB, null);
  33
  34     /*
  35      * pdbe2 and pdbe5 get removed as having a duplicate file path
  36      */
  37     PDBEntry[] uniques = StructureViewer.getUniquePdbFiles(new PDBEntry[] {
  38         pdbe1, pdbe2, pdbe3, pdbe4, pdbe5, pdbe6 });
  39     assertEquals(uniques,
  40  new PDBEntry[] { pdbe1, pdbe2, pdbe4, pdbe6 });
  41   }
  42 }