test/jalview/gui/StructureViewerTest.java

   1 package jalview.gui;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertNull;
   5
   6 import jalview.datamodel.PDBEntry;
   7 import jalview.datamodel.PDBEntry.Type;
   8
   9 import org.testng.annotations.Test;
  10
  11 public class StructureViewerTest
  12 {
  13   @Test(groups = "Functional")
  14   public void testGetUniquePdbFiles()
  15   {
  16     assertNull(StructureViewer.getUniquePdbFiles(null));
  17
  18     PDBEntry pdbe1 = new PDBEntry("1A70", "A", Type.PDB, "path1");
  19     PDBEntry pdbe2 = new PDBEntry("3A6S", "A", Type.PDB, "path2");
  20     PDBEntry pdbe3 = new PDBEntry("1A70", "B", Type.PDB, "path1");
  21     PDBEntry pdbe4 = new PDBEntry("1GAQ", "A", Type.PDB, null);
  22     PDBEntry pdbe5 = new PDBEntry("3A6S", "B", Type.PDB, "path2");
  23     PDBEntry pdbe6 = new PDBEntry("1GAQ", "B", Type.PDB, null);
  24
  25     /*
  26      * pdbe2 and pdbe5 get removed as having a duplicate file path
  27      */
  28     PDBEntry[] uniques = StructureViewer.getUniquePdbFiles(new PDBEntry[] {
  29         pdbe1, pdbe2, pdbe3, pdbe4, pdbe5, pdbe6 });
  30     assertEquals(uniques,
  31  new PDBEntry[] { pdbe1, pdbe2, pdbe4, pdbe6 });
  32   }
  33 }