test/jalview/io/BioJsHTMLOutputTest.java

   1 package jalview.io;
   2
   3 import java.io.File;
   4 import java.io.IOException;
   5 import java.net.URISyntaxException;
   6 import java.util.TreeMap;
   7
   8 import org.junit.Assert;
   9 import org.junit.Test;
  10
  11
  12 public class BioJsHTMLOutputTest
  13 {
  14
  15   @Test
  16   public void getJalviewAlignmentAsJsonString()
  17   {
  18     BioJsHTMLOutput bioJsHtmlOutput = new BioJsHTMLOutput(null, null);
  19     String bjsTemplate = null;
  20     try
  21     {
  22       bioJsHtmlOutput.updateBioJS();
  23       bjsTemplate = BioJsHTMLOutput.getBioJsTemplateAsString();
  24       // System.out.println(bjsTemplate);
  25     } catch (IOException e)
  26     {
  27       e.printStackTrace();
  28     }
  29     Assert.assertNotNull(bjsTemplate);
  30   }
  31
  32   @Test(expected = NullPointerException.class)
  33   public void expectedNullPointerException()
  34   {
  35     BioJsHTMLOutput bjs = new BioJsHTMLOutput(null, null);
  36     try
  37     {
  38       bjs.updateBioJSVersionsInfo(null);
  39     } catch (URISyntaxException e)
  40     {
  41       Assert.fail("Expception occured while testing!");
  42       e.printStackTrace();
  43     }
  44   }
  45
  46   @Test
  47   public void getBioJsMSAVersions()
  48   {
  49     BioJsHTMLOutput bjs = new BioJsHTMLOutput(null, null);
  50     TreeMap<String, File> versions = null;
  51     try
  52     {
  53       versions = bjs
  54               .updateBioJSVersionsInfo(BioJsHTMLOutput.BJS_TEMPLATES_LOCAL_DIRECTORY);
  55     } catch (URISyntaxException e)
  56     {
  57       Assert.fail("Expception occured while testing!");
  58       e.printStackTrace();
  59     }
  60     Assert.assertNotNull("No versions found", versions);
  61     Assert.assertTrue("One or more Templates required", versions.size() > 0);
  62     System.out
  63             .println("Number of discovered versions : "
  64             + versions.size());
  65     for (String v : versions.keySet())
  66     {
  67       System.out.println("version : " + v);
  68       System.out.println("File : " + versions.get(v));
  69     }
  70
  71     System.out.println("\nCurrent latest version : "
  72             + BioJsHTMLOutput.getCurrentBJSTemplateFile());
  73     Assert.assertNotNull("Latest BioJsMSA version NOT found!",
  74             BioJsHTMLOutput.getCurrentBJSTemplateFile());
  75
  76   }
  77 }