test/jalview/io/RNAMLfileTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
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   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
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  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
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  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.io;
  22
  23 import jalview.gui.JvOptionPane;
  24
  25 import java.io.File;
  26
  27 import org.testng.annotations.AfterClass;
  28 import org.testng.annotations.BeforeClass;
  29 import org.testng.annotations.Test;
  30
  31 public class RNAMLfileTest
  32 {
  33
  34   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  35   public void setUpJvOptionPane()
  36   {
  37     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
  38     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
  39   }
  40
  41   @BeforeClass(alwaysRun = true)
  42   public static void setUpBeforeClass() throws Exception
  43   {
  44   }
  45
  46   @AfterClass(alwaysRun = true)
  47   public static void tearDownAfterClass() throws Exception
  48   {
  49   }
  50
  51   @Test(groups = { "Functional" })
  52   public void testRnamlToStockholmIO()
  53   {
  54     StockholmFileTest.testFileIOwithFormat(
  55             new File("examples/testdata/rna-alignment.xml"),
  56             FileFormat.Stockholm, -1, -1, true, true, true);
  57
  58   }
  59
  60 }