test/jalview/renderer/ScaleRendererTest.java

   1 package jalview.renderer;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertFalse;
   5 import static org.testng.Assert.assertNull;
   6 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   7
   8 import jalview.gui.AlignFrame;
   9 import jalview.gui.AlignViewport;
  10 import jalview.io.DataSourceType;
  11 import jalview.io.FileLoader;
  12 import jalview.renderer.ScaleRenderer.ScaleMark;
  13
  14 import java.util.List;
  15
  16 import org.testng.annotations.Test;
  17
  18 public class ScaleRendererTest
  19 {
  20   @Test(groups = "Functional")
  21   public void testCalculateMarks()
  22   {
  23     String data = ">Seq/20-45\nABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYS\n";
  24     AlignFrame af = new FileLoader().LoadFileWaitTillLoaded(data,
  25             DataSourceType.PASTE);
  26     AlignViewport av = af.getViewport();
  27
  28     /*
  29      * scale has minor ticks at 5 and 15, major at 10 and 20
  30      * (these are base 1, ScaleMark holds base 0 values)
  31      */
  32     List<ScaleMark> marks = new ScaleRenderer().calculateMarks(av, 0, 25);
  33     assertEquals(marks.size(), 4);
  34
  35     assertFalse(marks.get(0).major);
  36     assertEquals(marks.get(0).column, 4);
  37     assertNull(marks.get(0).text);
  38
  39     assertTrue(marks.get(1).major);
  40     assertEquals(marks.get(1).column, 9);
  41     assertEquals(marks.get(1).text, "10");
  42
  43     assertFalse(marks.get(2).major);
  44     assertEquals(marks.get(2).column, 14);
  45     assertNull(marks.get(2).text);
  46
  47     assertTrue(marks.get(3).major);
  48     assertEquals(marks.get(3).column, 19);
  49     assertEquals(marks.get(3).text, "20");
  50
  51     /*
  52      * now hide columns 9-11 and 18-20 (base 1)
  53      * scale marks are now in the same columns as before, but
  54      * with column numbering adjusted for hidden columns
  55      */
  56     av.hideColumns(8, 10);
  57     av.hideColumns(17, 19);
  58     marks = new ScaleRenderer().calculateMarks(av, 0, 25);
  59     assertEquals(marks.size(), 4);
  60     assertFalse(marks.get(0).major);
  61     assertEquals(marks.get(0).column, 4);
  62     assertNull(marks.get(0).text);
  63     assertTrue(marks.get(1).major);
  64     assertEquals(marks.get(1).column, 9);
  65     assertEquals(marks.get(1).text, "13"); // +3 hidden columns
  66     assertFalse(marks.get(2).major);
  67     assertEquals(marks.get(2).column, 14);
  68     assertNull(marks.get(2).text);
  69     assertTrue(marks.get(3).major);
  70     assertEquals(marks.get(3).column, 19);
  71     assertEquals(marks.get(3).text, "26"); // +6 hidden columns
  72   }
  73 }