Merge branch 'Jalview-BH/JAL-3026-JAL-3063-JAXB' into
[jalview.git] / test / jalview / schemes / BuriedColourSchemeTest.java
1 package jalview.schemes;
2
3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
4
5 import java.awt.Color;
6
7 import org.testng.annotations.Test;
8
9 public class BuriedColourSchemeTest
10 {
11   /**
12    * Turn colours are based on the scores in ResidueProperties.buried A = 1.7, R
13    * = 0.1, N = 0.4, D = 0.4... min = 0.05 max = 4.6
14    * <p>
15    * scores are scaled to c 0-1 between min and max and colour is (0, 1-c, c)
16    */
17   @Test(groups = "Functional")
18   public void testFindColour()
19   {
20     ScoreColourScheme scheme = new BuriedColourScheme();
21
22     float min = 0.05f;
23     float max = 4.6f;
24     float a = (1.7f - min) / (max - min);
25     assertEquals(scheme.findColour('A', 0, null), new Color(0, 1 - a, a));
26
27     float d = (0.4f - min) / (max - min);
28     assertEquals(scheme.findColour('D', 0, null), new Color(0, 1 - d, d));
29
30     assertEquals(scheme.findColour('-', 0, null), Color.WHITE);
31   }
32
33 }