JAL-4036 Add getDbName to the GFTSPanelI and add an index code message to the index...
[jalview.git] / test / jalview / schemes / HydrophobicColourSchemeTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.schemes;
22
23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
24
25 import java.awt.Color;
26
27 import org.testng.annotations.Test;
28
29 public class HydrophobicColourSchemeTest
30 {
31   /**
32    * Turn colours are based on the scores in ResidueProperties.hyd A = 1.8, R =
33    * -4.5, N = -3.5, D = -3.5... min = -3.9 max = 4.5
34    * <p>
35    * scores are scaled to c 0-1 between min and max and colour is (c, 0, 1-c)
36    */
37   @Test(groups = "Functional")
38   public void testFindColour()
39   {
40     ScoreColourScheme scheme = new HydrophobicColourScheme();
41
42     float min = -3.9f;
43     float max = 4.5f;
44     float a = (1.8f - min) / (max - min);
45     assertEquals(scheme.findColour('A', 0, null), new Color(a, 0, 1 - a));
46
47     float d = (-3.5f - min) / (max - min);
48     assertEquals(scheme.findColour('D', 0, null), new Color(d, 0, 1 - d));
49
50     assertEquals(scheme.findColour('-', 0, null), Color.WHITE);
51   }
52
53 }