test/jalview/schemes/JalviewColourSchemeTest.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.schemes;
  22
  23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
  24 import static org.testng.Assert.assertTrue;
  25
  26 import org.testng.annotations.Test;
  27
  28 public class JalviewColourSchemeTest
  29 {
  30   @Test(groups = "Functional")
  31   public void testGetSchemeClass()
  32   {
  33     assertTrue(JalviewColourScheme.Clustal
  34             .getSchemeClass() == ClustalxColourScheme.class);
  35     assertTrue(JalviewColourScheme.Blosum62
  36             .getSchemeClass() == Blosum62ColourScheme.class);
  37     assertTrue(JalviewColourScheme.PID
  38             .getSchemeClass() == PIDColourScheme.class);
  39     assertTrue(JalviewColourScheme.Hydrophobic
  40             .getSchemeClass() == HydrophobicColourScheme.class);
  41     assertTrue(JalviewColourScheme.Zappo
  42             .getSchemeClass() == ZappoColourScheme.class);
  43     assertTrue(JalviewColourScheme.Taylor
  44             .getSchemeClass() == TaylorColourScheme.class);
  45     assertTrue(JalviewColourScheme.Helix
  46             .getSchemeClass() == HelixColourScheme.class);
  47     assertTrue(JalviewColourScheme.Strand
  48             .getSchemeClass() == StrandColourScheme.class);
  49     assertTrue(JalviewColourScheme.Turn
  50             .getSchemeClass() == TurnColourScheme.class);
  51     assertTrue(JalviewColourScheme.Buried
  52             .getSchemeClass() == BuriedColourScheme.class);
  53     assertTrue(JalviewColourScheme.Nucleotide
  54             .getSchemeClass() == NucleotideColourScheme.class);
  55     assertTrue(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine
  56             .getSchemeClass() == PurinePyrimidineColourScheme.class);
  57     assertTrue(JalviewColourScheme.TCoffee
  58             .getSchemeClass() == TCoffeeColourScheme.class);
  59     assertTrue(JalviewColourScheme.RNAHelices
  60             .getSchemeClass() == RNAHelicesColour.class);
  61     assertTrue(JalviewColourScheme.IdColour
  62             .getSchemeClass() == IdColourScheme.class);
  63   }
  64
  65   @Test(groups = "Functional")
  66   public void testToString()
  67   {
  68     assertEquals(JalviewColourScheme.Clustal.toString(), "Clustal");
  69     assertEquals(JalviewColourScheme.Blosum62.toString(), "Blosum62");
  70     assertEquals(JalviewColourScheme.PID.toString(), "% Identity");
  71     assertEquals(JalviewColourScheme.Zappo.toString(), "Zappo");
  72     assertEquals(JalviewColourScheme.Taylor.toString(), "Taylor");
  73     assertEquals(JalviewColourScheme.Hydrophobic.toString(), "Hydrophobic");
  74     assertEquals(JalviewColourScheme.Helix.toString(), "Helix Propensity");
  75     assertEquals(JalviewColourScheme.Strand.toString(),
  76             "Strand Propensity");
  77     assertEquals(JalviewColourScheme.Turn.toString(), "Turn Propensity");
  78     assertEquals(JalviewColourScheme.Buried.toString(), "Buried Index");
  79     assertEquals(JalviewColourScheme.Nucleotide.toString(), "Nucleotide");
  80     assertEquals(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine.toString(),
  81             "Purine/Pyrimidine");
  82     assertEquals(JalviewColourScheme.TCoffee.toString(), "T-Coffee Scores");
  83     assertEquals(JalviewColourScheme.RNAHelices.toString(), "RNA Helices");
  84     assertEquals(JalviewColourScheme.IdColour.toString(), "Sequence ID");
  85   }
  86 }