test/jalview/schemes/JalviewColourSchemeTest.java

   1 package jalview.schemes;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   5
   6 import org.testng.annotations.Test;
   7
   8 public class JalviewColourSchemeTest
   9 {
  10   @Test(groups = "Functional")
  11   public void testGetSchemeClass()
  12   {
  13     assertTrue(JalviewColourScheme.Clustal.getSchemeClass() == ClustalxColourScheme.class);
  14     assertTrue(JalviewColourScheme.Blosum62.getSchemeClass() == Blosum62ColourScheme.class);
  15     assertTrue(JalviewColourScheme.PID.getSchemeClass() == PIDColourScheme.class);
  16     assertTrue(JalviewColourScheme.Hydrophobic.getSchemeClass() == HydrophobicColourScheme.class);
  17     assertTrue(JalviewColourScheme.Zappo.getSchemeClass() == ZappoColourScheme.class);
  18     assertTrue(JalviewColourScheme.Taylor.getSchemeClass() == TaylorColourScheme.class);
  19     assertTrue(JalviewColourScheme.Helix.getSchemeClass() == HelixColourScheme.class);
  20     assertTrue(JalviewColourScheme.Strand.getSchemeClass() == StrandColourScheme.class);
  21     assertTrue(JalviewColourScheme.Turn.getSchemeClass() == TurnColourScheme.class);
  22     assertTrue(JalviewColourScheme.Buried.getSchemeClass() == BuriedColourScheme.class);
  23     assertTrue(JalviewColourScheme.Nucleotide.getSchemeClass() == NucleotideColourScheme.class);
  24     assertTrue(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine.getSchemeClass() == PurinePyrimidineColourScheme.class);
  25     assertTrue(JalviewColourScheme.TCoffee.getSchemeClass() == TCoffeeColourScheme.class);
  26     assertTrue(JalviewColourScheme.RNAHelices.getSchemeClass() == RNAHelicesColour.class);
  27   }
  28
  29   @Test(groups = "Functional")
  30   public void testToString()
  31   {
  32     assertEquals(JalviewColourScheme.Clustal.toString(), "Clustal");
  33     assertEquals(JalviewColourScheme.Blosum62.toString(), "Blosum62");
  34     assertEquals(JalviewColourScheme.PID.toString(), "% Identity");
  35     assertEquals(JalviewColourScheme.Zappo.toString(), "Zappo");
  36     assertEquals(JalviewColourScheme.Taylor.toString(), "Taylor");
  37     assertEquals(JalviewColourScheme.Hydrophobic.toString(), "Hydrophobic");
  38     assertEquals(JalviewColourScheme.Helix.toString(), "Helix Propensity");
  39     assertEquals(JalviewColourScheme.Strand.toString(), "Strand Propensity");
  40     assertEquals(JalviewColourScheme.Turn.toString(), "Turn Propensity");
  41     assertEquals(JalviewColourScheme.Buried.toString(), "Buried Index");
  42     assertEquals(JalviewColourScheme.Nucleotide.toString(), "Nucleotide");
  43     assertEquals(JalviewColourScheme.PurinePyrimidine.toString(),
  44             "Purine/Pyrimidine");
  45     assertEquals(JalviewColourScheme.TCoffee.toString(), "T-Coffee Scores");
  46     assertEquals(JalviewColourScheme.RNAHelices.toString(), "RNA Helices");
  47   }
  48 }