test/jalview/testutils/AnnotationsMatcherTest.java

   1 package jalview.testutils;
   2
   3 import org.testng.annotations.DataProvider;
   4 import org.testng.annotations.Test;
   5 import jalview.datamodel.Annotation;
   6
   7 import static org.hamcrest.MatcherAssert.assertThat;
   8
   9 import java.awt.Color;
  10 import java.util.*;
  11
  12 public class AnnotationsMatcherTest
  13 {
  14   @DataProvider
  15   public Object[][] matchingAnnotationsLists()
  16   {
  17     return new Object[][] {
  18         {
  19             new Annotation[] {
  20                 new Annotation("C", "", 'C', 0.0f),
  21                 new Annotation("C", "", 'C', 0.1f),
  22                 new Annotation("B", "", 'B', 0.2f) },
  23             new Annotation[] {
  24                 new Annotation("C", "", 'C', 0.0f),
  25                 new Annotation("C", "", 'C', 0.1f),
  26                 new Annotation("B", "", 'B', 0.2f) } },
  27         {
  28             new Annotation[] {
  29                 new Annotation("X", "xxx", 'X', 1.3f),
  30                 new Annotation("V", "vvv", 'V', 1.5f),
  31                 new Annotation("B", "bbb", 'B', 2.5f) },
  32             new Annotation[] {
  33                 new Annotation("X", "xxx", 'X', 1.3f),
  34                 new Annotation("V", "vvv", 'V', 1.5f),
  35                 new Annotation("B", "bbb", 'B', 2.5f) } },
  36         {
  37             new Annotation[] {
  38                 new Annotation("A", "", 'A', 0.2f, Color.RED),
  39                 new Annotation("A", "", 'A', 0.3f, Color.GREEN),
  40                 new Annotation("C", "", 'C', 0.4f, Color.YELLOW),
  41                 new Annotation("C", "", 'C', 0.5f) },
  42             new Annotation[] {
  43                 new Annotation("A", "", 'A', 0.2f, Color.RED),
  44                 new Annotation("A", "", 'A', 0.3f, Color.GREEN),
  45                 new Annotation("C", "", 'C', 0.4f, Color.YELLOW),
  46                 new Annotation("C", "", 'C', 0.5f) } },
  47         {
  48             new Annotation[] {
  49                 Annotation.EMPTY_ANNOTATION, Annotation.EMPTY_ANNOTATION },
  50             new Annotation[] {
  51                 Annotation.EMPTY_ANNOTATION, Annotation.EMPTY_ANNOTATION } } };
  52   }
  53
  54   @Test(groups = { "Functional" }, dataProvider = "matchingAnnotationsLists")
  55   public void testMatchesSafely_matchingAnnotations(Annotation[] template,
  56       Annotation[] testdata)
  57   {
  58     assert new AnnotationsMatcher(Arrays.asList(template))
  59         .matchesSafely(testdata);
  60   }
  61
  62   @DataProvider
  63   public Object[][] matchingAnnotations()
  64   {
  65     return new Object[][] {
  66         {
  67             new Annotation("A", "aaa", 'A', 0.1f),
  68             new Annotation("A", "aaa", 'A', 0.1f) },
  69         {
  70             new Annotation("A", "abcdef", 'A', 0.1f, Color.RED),
  71             new Annotation("A", "abcdef", 'A', 0.1f, Color.RED) },
  72         {
  73             new Annotation("", "xxxx", ' ', 0.0f),
  74             new Annotation("", "xxxx", ' ', 0.0f) },
  75         {
  76             new Annotation("", "", ' ', 0.0f),
  77             new Annotation("", "", ' ', 0.0f) },
  78         {
  79             new Annotation(null, null, ' ', 0.0f),
  80             new Annotation(null, null, ' ', 0.0f) },
  81         {
  82             new Annotation(null, "", ' ', 0.0f),
  83             new Annotation("", null, ' ', 0.0f) } };
  84   }
  85
  86   @Test(groups = { "Functional" }, dataProvider = "matchingAnnotations")
  87   public void testAnnotationsEqual_matchingAnnotations(Annotation first,
  88       Annotation second)
  89   {
  90     assert AnnotationsMatcher.annotationsEqual(first, second);
  91   }
  92
  93   @Test(groups = { "Functional" })
  94   public void testAnnotationsEqual_compareNullDisplayCharToEmpty()
  95   {
  96     assert AnnotationsMatcher
  97         .annotationsEqual(new Annotation("", "description", 'A', 0.1f),
  98             new Annotation(null, "description", 'A', 0.1f));
  99     assert AnnotationsMatcher
 100         .annotationsEqual(new Annotation(null, "description", 'A', 0.1f),
 101             new Annotation("", "description", 'A', 0.1f));
 102   }
 103
 104   @Test(groups = { "Functional" })
 105   public void testAnnotationsEqual_compareNullDescriptionToEmpty()
 106   {
 107     assert AnnotationsMatcher
 108         .annotationsEqual(new Annotation("A", null, 'A', 0.2f),
 109             new Annotation("A", "", 'A', 0.2f));
 110     assert AnnotationsMatcher
 111         .annotationsEqual(new Annotation("A", "", 'A', 0.2f),
 112             new Annotation("A", null, 'A', 0.2f));
 113   }
 114
 115   @Test(groups = { "Functional" })
 116   public void testAnnotationsEqual_compareNullDisplayCharToBlank()
 117   {
 118     assert !AnnotationsMatcher
 119         .annotationsEqual(new Annotation(" ", "aaa", 'A', 0.03f),
 120             new Annotation(null, "aaa", 'A', 0.03f));
 121     assert !AnnotationsMatcher
 122         .annotationsEqual(new Annotation(null, "aaa", 'A', 0.04f),
 123             new Annotation(" ", "aaa", 'A', 0.04f));
 124   }
 125
 126   @Test(groups = { "Functional" })
 127   public void testAnnotationsEqual_compareNullDescriptionToBlank()
 128   {
 129     assert !AnnotationsMatcher
 130         .annotationsEqual(new Annotation("A", null, 'A', 0.0f),
 131             new Annotation("A", " ", 'A', 0.0f));
 132     assert !AnnotationsMatcher
 133         .annotationsEqual(new Annotation("A", " ", 'A', 0.01f),
 134             new Annotation("A", null, 'A', 0.01f));
 135   }
 136 }