JAL-4313 Patch AnnotationsMatcher to match nulls
[jalview.git] / test / jalview / util / SparseCountTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.util;
22
23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
24 import static org.testng.Assert.assertFalse;
25 import static org.testng.Assert.assertTrue;
26
27 import jalview.gui.JvOptionPane;
28
29 import org.testng.annotations.BeforeClass;
30 import org.testng.annotations.Test;
31
32 public class SparseCountTest
33 {
34
35   @BeforeClass(alwaysRun = true)
36   public void setUpJvOptionPane()
37   {
38     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
39     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
40   }
41
42   @Test(groups = "Functional")
43   public void testAdd()
44   {
45     SparseCount p = new SparseCount(8);
46     p.add('a', 1);
47     p.add('b', 2);
48     p.add('a', 3);
49     p.add('b', -4);
50     assertEquals(p.size(), 2);
51     assertEquals(p.get('a'), 4);
52     assertEquals(p.get('b'), -2);
53   }
54
55   @Test(groups = "Functional")
56   public void testPut()
57   {
58     SparseCount p = new SparseCount(8);
59     p.put('a', 3);
60     p.add('b', 2);
61     p.put('b', 4);
62     assertEquals(p.size(), 2);
63     assertEquals(p.get('a'), 3);
64     assertEquals(p.get('b'), 4);
65   }
66
67   /**
68    * Test handling overflow of short by switching to counting ints
69    */
70   @Test(groups = "Functional")
71   public void testOverflow()
72   {
73     SparseCount p = new SparseCount(8);
74     p.put('a', Short.MAX_VALUE - 1);
75     p.add('a', 1);
76     assertFalse(p.isUsingInt());
77     p.add('a', 1);
78     assertTrue(p.isUsingInt());
79   }
80
81   /**
82    * Test handling underflow of short by switching to counting ints
83    */
84   @Test(groups = "Functional")
85   public void testUnderflow()
86   {
87     SparseCount p = new SparseCount(8);
88     p.put('a', Short.MIN_VALUE + 1);
89     p.add('a', -1);
90     assertFalse(p.isUsingInt());
91     p.add('a', -1);
92     assertTrue(p.isUsingInt());
93   }
94
95   @Test(groups = "Functional")
96   public void testKeyAt_ValueAt()
97   {
98     SparseCount p = new SparseCount(8);
99     p.put('W', 12);
100     p.put('K', 9);
101     p.put('R', 6);
102     assertEquals(p.size(), 3);
103     assertEquals(p.keyAt(0), 'K');
104     assertEquals(p.valueAt(0), 9);
105     assertEquals(p.keyAt(1), 'R');
106     assertEquals(p.valueAt(1), 6);
107     assertEquals(p.keyAt(2), 'W');
108     assertEquals(p.valueAt(2), 12);
109   }
110
111 }