JAL-2546 JAL-2490 efficient lookup of features, correct handling of
[jalview.git] / test / jalview / util / SparseCountTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package jalview.util;
22
23 import static org.testng.Assert.assertEquals;
24 import static org.testng.Assert.assertFalse;
25 import static org.testng.Assert.assertTrue;
26
27 import jalview.gui.JvOptionPane;
28
29 import org.testng.annotations.BeforeClass;
30 import org.testng.annotations.Test;
31 public class SparseCountTest
32 {
33
34   @BeforeClass(alwaysRun = true)
35   public void setUpJvOptionPane()
36   {
37     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
38     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
39   }
40
41   @Test(groups = "Functional")
42   public void testAdd()
43   {
44     SparseCount p = new SparseCount(8);
45     p.add('a', 1);
46     p.add('b', 2);
47     p.add('a', 3);
48     p.add('b', -4);
49     assertEquals(p.size(), 2);
50     assertEquals(p.get('a'), 4);
51     assertEquals(p.get('b'), -2);
52   }
53
54   @Test(groups = "Functional")
55   public void testPut()
56   {
57     SparseCount p = new SparseCount(8);
58     p.put('a', 3);
59     p.add('b', 2);
60     p.put('b', 4);
61     assertEquals(p.size(), 2);
62     assertEquals(p.get('a'), 3);
63     assertEquals(p.get('b'), 4);
64   }
65
66   /**
67    * Test handling overflow of short by switching to counting ints
68    */
69   @Test(groups = "Functional")
70   public void testOverflow()
71   {
72     SparseCount p = new SparseCount(8);
73     p.put('a', Short.MAX_VALUE - 1);
74     p.add('a', 1);
75     assertFalse(p.isUsingInt());
76     p.add('a', 1);
77     assertTrue(p.isUsingInt());
78   }
79
80   /**
81    * Test handling underflow of short by switching to counting ints
82    */
83   @Test(groups = "Functional")
84   public void testUnderflow()
85   {
86     SparseCount p = new SparseCount(8);
87     p.put('a', Short.MIN_VALUE + 1);
88     p.add('a', -1);
89     assertFalse(p.isUsingInt());
90     p.add('a', -1);
91     assertTrue(p.isUsingInt());
92   }
93
94   @Test(groups = "Functional")
95   public void testKeyAt_ValueAt()
96   {
97     SparseCount p = new SparseCount(8);
98     p.put('W', 12);
99     p.put('K', 9);
100     p.put('R', 6);
101     assertEquals(p.size(), 3);
102     assertEquals(p.keyAt(0), 'K');
103     assertEquals(p.valueAt(0), 9);
104     assertEquals(p.keyAt(1), 'R');
105     assertEquals(p.valueAt(1), 6);
106     assertEquals(p.keyAt(2), 'W');
107     assertEquals(p.valueAt(2), 12);
108   }
109
110 }