test/jalview/util/matcher/KeyedMatcherTest.java

   1 package jalview.util.matcher;
   2
   3 import static org.testng.Assert.assertEquals;
   4 import static org.testng.Assert.assertFalse;
   5 import static org.testng.Assert.assertTrue;
   6
   7 import java.util.function.Function;
   8
   9 import org.testng.annotations.Test;
  10
  11 public class KeyedMatcherTest
  12 {
  13   @Test
  14   public void testMatches()
  15   {
  16     /*
  17      * a numeric matcher - MatcherTest covers more conditions
  18      */
  19     MatcherI m1 = new Matcher(Condition.GE, -2f);
  20     KeyedMatcherI km = new KeyedMatcher("AF", m1);
  21     assertTrue(km.matches(key -> "-2"));
  22     assertTrue(km.matches(key -> "-1"));
  23     assertFalse(km.matches(key -> "-3"));
  24     assertFalse(km.matches(key -> ""));
  25     assertFalse(km.matches(key -> "junk"));
  26     assertFalse(km.matches(key -> null));
  27
  28     /*
  29      * a string pattern matcher
  30      */
  31     MatcherI m2 = new Matcher(Condition.Contains, "Cat");
  32     km = new KeyedMatcher("AF", m2);
  33     assertTrue(km.matches(key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
  34             : "showers"));
  35   }
  36
  37   @Test
  38   public void testAnd()
  39   {
  40     // condition1: AF value contains "dog" (matches)
  41     KeyedMatcherI km1 = new KeyedMatcher("AF", new Matcher(
  42             Condition.Contains, "dog"));
  43
  44     Function<String, String> vp = key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
  45             : "showers";
  46     assertTrue(km1.matches(vp));
  47
  48     // condition 2: CSQ value does not contain "how" (does not match)
  49     KeyedMatcherI km2 = km1.and("CSQ", new Matcher(Condition.NotContains,
  50             "how"));
  51     assertFalse(km2.matches(vp));
  52   }
  53
  54   @Test
  55   public void testToString()
  56   {
  57     KeyedMatcherI km = new KeyedMatcher("AF",
  58             new Matcher(Condition.LT, 1.2f));
  59     assertEquals(km.toString(), "AF LT 1.2");
  60
  61     /*
  62      * add an AND condition
  63      */
  64     km = km.and("CLIN_SIG", new Matcher(Condition.NotContains, "path"));
  65     assertEquals(km.toString(), "CLIN_SIG NotContains PATH AND (AF LT 1.2)");
  66
  67     /*
  68      * add an OR condition
  69      */
  70     km = km.or("CSQ", new Matcher(Condition.Contains, "benign"));
  71     assertEquals(km.toString(),
  72             "CSQ Contains BENIGN OR (CLIN_SIG NotContains PATH AND (AF LT 1.2))");
  73   }
  74
  75   @Test
  76   public void testOr()
  77   {
  78     // condition1: AF value contains "dog" (matches)
  79     KeyedMatcherI km1 = new KeyedMatcher("AF", new Matcher(
  80             Condition.Contains, "dog"));
  81
  82     Function<String, String> vp = key -> "AF".equals(key) ? "raining cats and dogs"
  83             : "showers";
  84     assertTrue(km1.matches(vp));
  85
  86     // condition 2: CSQ value does not contain "how" (does not match)
  87     // the OR combination still passes
  88     KeyedMatcherI km2 = km1.or("CSQ", new Matcher(Condition.NotContains,
  89             "how"));
  90     assertTrue(km2.matches(vp));
  91   }
  92 }