JAL-3906 use indicate to highlight current mousedOver residue in Jalview in a Pymol...
[jalview.git] / test / mc_view / ResidueTest.java
1 /*
2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
4  * 
5  * This file is part of Jalview.
6  * 
7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
8  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
10  * of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
20  */
21 package mc_view;
22
23 import static org.testng.AssertJUnit.assertNull;
24 import static org.testng.AssertJUnit.assertSame;
25
26 import jalview.gui.JvOptionPane;
27
28 import java.util.Vector;
29
30 import org.testng.annotations.BeforeClass;
31 import org.testng.annotations.Test;
32
33 public class ResidueTest
34 {
35
36   @BeforeClass(alwaysRun = true)
37   public void setUpJvOptionPane()
38   {
39     JvOptionPane.setInteractiveMode(false);
40     JvOptionPane.setMockResponse(JvOptionPane.CANCEL_OPTION);
41   }
42
43   @Test(groups = { "Functional" })
44   public void testFindAtom()
45   {
46     Atom a1 = new Atom(1f, 2f, 3f);
47     a1.name = "C";
48     Atom a2 = new Atom(1f, 2f, 3f);
49     a2.name = "A";
50     Atom a3 = new Atom(1f, 2f, 3f);
51     a3.name = "P";
52     Atom a4 = new Atom(1f, 2f, 3f);
53     a4.name = "C";
54     Vector<Atom> v = new Vector<Atom>();
55     v.add(a1);
56     v.add(a2);
57     v.add(a3);
58     v.add(a4);
59     Residue r = new Residue(v, 293, 12);
60
61     assertSame(a1, r.findAtom("C"));
62     assertSame(a2, r.findAtom("A"));
63     assertSame(a3, r.findAtom("P"));
64     assertNull(r.findAtom("S"));
65   }
66 }