utils/getdown/jalviewc

   1 #!/usr/bin/env bash
   2
   3 ARG1=$1
   4 WDIR="$( pwd )"
   5 DIR="$( cd "$( dirname "${BASH_SOURCE[0]}" )" &> /dev/null && pwd )"
   6
   7 # check to see if $1 is set and is not start of other cli set args
   8 OPEN=""
   9 if [ -n "$ARG1" -a "$ARG1" = "${ARG1#-}" -a \! "$ARG1" = "open" ]; then
  10  # first argument exists and does not start with a "-" and is not "open"
  11  OPEN="-open"
  12 fi
  13
  14 APPDIR="${DIR}"
  15 JAVA="${APPDIR}/jre/bin/java"
  16 GETDOWNTXT="${APPDIR}/getdown.txt"
  17 if [ -e "$GETDOWNTXT" ]; then
  18   CLASSPATH=""
  19   for x in $(grep -e 'code = ' "${GETDOWNTXT}" | sed -e 's/^code\s*=\s*//;'); do
  20     [ -n "$CLASSPATH" ] && CLASSPATH="${CLASSPATH}:"
  21     CLASSPATH="${CLASSPATH}${APPDIR}/${x}"
  22   done
  23 else
  24   echo "Cannot find getdown.txt" >&2
  25   exit 1
  26 fi
  27
  28 "$JAVA" -cp "$CLASSPATH" jalview.bin.Launcher $OPEN "$@"