refactored das sequence source creation code to the implementor of the das source...
[jalview.git] / utils / jhindexer
1 #! /bin/sh
2 # This builds a search database 
3
4 # Cygwin support.  $cygwin _must_ be set to either true or false.
5 case "`uname`" in
6   CYGWIN*) cygwin=true ;;
7   *) cygwin=false ;;
8 esac
9
10 # For Cygwin, ensure paths are in UNIX format before anything is touched
11 if $cygwin; then
12   [ -n "$JAVAHELP_HOME" ] &&
13     JAVAHELP_HOME=`cygpath --unix "$JAVAHELP_HOME"`
14 fi
15
16 if [ "$JAVAHELP_HOME" = "" ] ; then
17   # try to find jhindexer
18   if [ -d /opt/javahelp ] ; then 
19     JAVAHELP_HOME=/opt/javahelp
20   fi
21
22   if [ -d ${HOME}/opt/jhindexer ] ; then 
23     JAVAHELP_HOME=${HOME}/opt/javahelp
24   fi
25
26   ## resolve links - $0 may be a link to javahelp's home
27   PRG=$0
28   progname=`basename $0`
29   
30   while [ -h "$PRG" ] ; do
31     ls=`ls -ld "$PRG"`
32     link=`expr "$ls" : '.*-> \(.*\)$'`
33     if expr "$link" : '.*/.*' > /dev/null; then
34         PRG="$link"
35     else
36         PRG="`dirname $PRG`/$link"
37     fi
38   done
39   
40   JAVAHELP_HOME=`dirname "$PRG"`/../..
41
42 fi
43
44 # For Cygwin, switch paths to Windows format before running java
45 if $cygwin; then
46   JAVAHELP_HOME=`cygpath --path --windows "$JAVAHELP_HOME"`
47 fi
48
49 java -jar $JAVAHELP_HOME/javahelp/bin/jhindexer.jar "$@"