website/version2/examples/serprot.msf

   1 PileUp\r
   2 \r
   3 \r
   4 \r
   5    MSF:  279  Type: P    Check:  9995   .. \r
   6 \r
   7  Name: KYBOA oo  Len:  279  Check:  4492  Weight:  1.00\r
   8  Name: TRBOTR oo  Len:  279  Check:  6670  Weight:  1.00\r
   9  Name: ELPG oo  Len:  279  Check:  6037  Weight:  1.00\r
  10  Name: PRRTG oo  Len:  279  Check:  3057  Weight:  1.00\r
  11  Name: KQHUP oo  Len:  279  Check:  6499  Weight:  1.00\r
  12  Name: TRSMG oo  Len:  279  Check:  3240  Weight:  1.00\r
  13 \r
  14 //\r
  15 \r
  16 \r
  17 \r
  18 KYBOA           .CGVP..... AIQPVLSGLS .........R IVNGEEAVPG SWPWQVSLQD \r
  19 TRBOTR          .......... .....VDDDD .........K IVGGYTCGAN TVPYQVSLN. \r
  20 ELPG            .......... .......... .......... VVGGTEAQRN SWPSQISLQY \r
  21 PRRTG           .......... .......... .......... IIGGVESIPH SRPYMAHLDI \r
  22 KQHUP           AYGTQGSSGY SLRLCNTGDN SVCTTKTSTR IVGGTNSSWG EWPWQVSLQV \r
  23 TRSMG           .......... .......... .......... VVGGTRAAQG EFPFMVRLS. \r
  24 \r
  25 \r
  26 KYBOA           K...TGFHFC GGSLINENWV VTAAHCG... ..VTTSDVVV AGEFDQGSSS \r
  27 TRBOTR          ....SGYHFC GGSLINSQWV VSAAHCY... ..KSGIQVRL G.EDNINVVE \r
  28 ELPG            RSGSSWAHTC GGTLIRQNWV MTAAHCVD.. .RELTFRVVV G.EHNLNQNN \r
  29 PRRTG           VTEKGLRVIC GGFLISRQFV LTAAHCK... ..GREITVIL G.AHDVRKRE \r
  30 KQHUP           K.LTAQRHLC GGSLIGHQWV LTAAHCFDGL PLQDVWRIYS G.ILNLSDIT \r
  31 TRSMG           .......MGC GGALYAQDIV LTAAHCVS.. ..GSGNNTSI TATGGVVDLQ \r
  32 \r
  33 \r
  34 KYBOA           EKIQKLKIAK VFKNSKYNSL TINN..DITL LKLSTAASFS QTVSAVCLPS \r
  35 TRBOTR          GNEQFISASK SIVHPSYNSN TLNN..DIML IKLKSAASLN SRVASISLPT \r
  36 ELPG            GTEQYVGVQK IVVHPYWNTD DVAAGYDIAL LRLAQSVTLN SYVQLGVLPR \r
  37 PRRTG           STQQKIKVEK QIIHESYNSV PNLH..DIML LKLEKKVELT PAVNVVPLPS \r
  38 KQHUP           KDTPFSQIKE IIIHQNYKVS EGNH..DIAL IKLQAPLNYT EFQKPICLPS \r
  39 TRSMG           S.AVKVRSTK VLQAPGYNGT G.K...DWAL IKLAQPINQ. P.....TLKI \r
  40 \r
  41 \r
  42 KYBOA           ASDDFAAGTT CVTTGWGLTR YTNANTPDRL QQASLPLLSN TNCKK..YWG \r
  43 TRBOTR          S..CASAGTQ CLISGWGNTK SSGTSYPDVL KCLKAPILSD SSCKS..AYP \r
  44 ELPG            AGTILANNSP CYITGWGLTR .TNGQLAQTL QQAYLPTVDY AICSSSSYWG \r
  45 PRRTG           PSDFIHPGAM CWAAGWGKTG .VRDPTSYTL REVELRIMDE KACVD...YR \r
  46 KQHUP           KGDTSTIYTN CWVTGWGFSK .EKGEIQNIL QKVNIPLVTN EECQKR.YQD \r
  47 TRSMG           ATTTAYNQGT FTVAGWGANR .EGGSQQRYL LKANVPFVSD AACRS.AYGN \r
  48 \r
  49 \r
  50 KYBOA           TKIKDAMICA G...ASGVSS .CMGDSGGPL VCKK.NGAWT LVGIVSWGS. \r
  51 TRBOTR          GQITSNMFCA GY.LEGGKDS .CQGDSGGPV VCS...G..K LQGIVSWGS. \r
  52 ELPG            STVKNSMVCA G...GNGVRS GCQGDSGGPL HCLV.NGQYA VHGVTSFVSR \r
  53 PRRTG           YYEYKFQVCV G..SPTTLRA AFMGDSGGPL LCA...G..V AHGIVSYGH. \r
  54 KQHUP           YKITQRMVCA GY.KEGGKDA .CKGDSGGPL VCKH.NGMWR LVGITSWGE. \r
  55 TRSMG           ELVANEEICA GYPDTGGVDT .CQGDSGGPM FRKDNADEWI QVGIVSWGY. \r
  56 \r
  57 \r
  58 KYBOA           .STCSTSTPG VYARVTALVN WVQQTLAAN\r
  59 TRBOTR          .GCAQKNKPG VYTKVCNYVS WIKQTIASN\r
  60 ELPG            LGCNVTRKPT VFTRVSAYIS WINNVIASN\r
  61 PRRTG           ...PDAKPPA IFTRVSTYVP TINAVIN..\r
  62 KQHUP           .GCARREQPG V......... .........\r
  63 TRSMG           .GCARPGYPG VYTEVSTFAS AIASAARTL\r
  64 \r
  65 \r