- String default_config_filename = Constants.DEFAULT_CONFIGURATION_FILE_NAME;
- final static String display_options[][] = {
- { "Phylogram", "display", "?" }, { "Node Name", "display", "yes" }, { "Taxonomy Code", "display", "yes" },
- { "Annotation", "nodisplay", "no" }, { "Confidence Values", "display", "?" },
- { "Node Events", "display", "?" }, { "Taxonomy Colorize", "display", "yes" },
- { "Colorize Branches", "display", "no" }, { "Use Branch-Widths", "display", "no" },
- { "Show Custom Nodes", "display", "yes" }, { "Domains", "nodisplay", "no" },
- { "Binary Characters", "nodisplay", "no" }, { "Binary Char Counts", "nodisplay", "no" },
- { "Seq Name", "display", "yes" }, { "Seq Acc", "display", "no" },
- { "Show Internal Data", "display", "yes" }, { "Dyna Hide", "display", "yes" },
- { "Taxonomy Scientific", "display", "yes" }, { "Taxonomy Common", "display", "no" },
- { "Annotation Colorize", "nodisplay", "no" }, { "Seq Symbol", "display", "yes" },
- { "Rollover", "display", "yes" }, { "Relation Confidence", "nodisplay", "no" },
- { "Vector Data", "nodisplay", "no" }, { "Taxonomy Images", "display", "no" },
- { "Properties", "nodisplay", "no" } };
- final static String clickto_options[][] = {
- { "Display Node Data", "display" }, { "Collapse/Uncollapse", "display" }, { "Root/Reroot", "display" },
- { "Sub/Super Tree", "display" }, { "Swap Descendants", "display" }, { "Colorize Subtree", "display" },
- { "Open Sequence Web", "display" }, { "Open Taxonomy Web", "display" }, { "Blast", "display" },
- { "Cut Subtree", "display" }, { "Copy Subtree", "display" }, { "Paste Subtree", "display" },
- { "Delete Subtree/Node", "display" }, { "Add New Node", "display" }, { "Edit Node Data", "display" },
- { "Sort Descendants", "display" }, { "Return", "display" }, { "Select Node(s)", "display" } };