- _path_to_local_mafft = createLocalPath( path_to_local_mafft ) != null ? createLocalPath( path_to_local_mafft )
- : createLocalPath( new File( "mafft" ) );
- _path_to_local_kalign = createLocalPath( path_to_local_kalign ) != null ? createLocalPath( path_to_local_kalign )
- : createLocalPath( new File( "kalign" ) );
- _path_to_local_fastme = createLocalPath( path_to_local_fastme ) != null ? createLocalPath( path_to_local_fastme )
- : createLocalPath( new File( "fastme" ) );
- _path_to_local_raxml = createLocalPath( path_to_local_raxml ) != null ? createLocalPath( path_to_local_raxml )
- : createLocalPath( new File( "raxml" ) );
- _path_to_local_clustalo = createLocalPath( path_to_local_clustalo ) != null ? createLocalPath( path_to_local_clustalo )
- : createLocalPath( new File( ForesterUtil.isWindowns() ? "clustalo.exe" : "clustalo" ) );
+ _path_to_local_mafft = createLocalPath( path_to_local_mafft, "mafft" );
+ _path_to_local_fastme = createLocalPath( path_to_local_fastme, "fastme" );
+ _path_to_local_raxml = createLocalPath( path_to_local_raxml, "raxml" );
+ _path_to_local_clustalo = createLocalPath( path_to_local_clustalo, "clustalo" );