- System.out.println( sdi4.getDuplicationsSumStats().getSummaryAsString() );
- Archaeopteryx.createApplication( sdi4.getMinDuplicationsSumGeneTrees().get( 0 ) );
- // if ( !PhylogenyMethods.calculateLCA( g1.getNode( "B" ), g1.getNode( "A1" ) ).getNodeData().getEvent()
- // .isSpeciation() ) {
- // return false;
- // }
- // if ( !PhylogenyMethods.calculateLCA( g1.getNode( "C" ), g1.getNode( "A1" ) ).getNodeData().getEvent()
- // .isSpeciationOrDuplication() ) {
- // return false;
- // }
- // if ( !( PhylogenyMethods.calculateLCA( g1.getNode( "A2" ), g1.getNode( "A1" ) ).getNodeData().getEvent()
- // .isDuplication() ) ) {
- // return false;
- // }
- // if ( !PhylogenyMethods.calculateLCA( g1.getNode( "D" ), g1.getNode( "A1" ) ).getNodeData().getEvent()
- // .isSpeciation() ) {
- // return false;
- // }