unless File.exist? dsx_output + ".fasta"
puts "e. dsx:"
cmd = "#{DSX} -d -e=1e-#{e_value_exp.to_s} -l=#{length} #{hmm_name} #{hmmscan_output} #{input} #{dsx_output}"
unless File.exist? dsx_output + ".fasta"
puts "e. dsx:"
cmd = "#{DSX} -d -e=1e-#{e_value_exp.to_s} -l=#{length} #{hmm_name} #{hmmscan_output} #{input} #{dsx_output}"