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JAL-2228 updated script in help docs, renamed docs, and added note about non-backward...
[jalview.git] / help / html / features / featuresFormat.html
diff --git a/help/html/features/featuresFormat.html b/help/html/features/featuresFormat.html
index cdd803c..fd6b99f 100755 (executable)
--- a/help/html/features/featuresFormat.html
+++ b/help/html/features/featuresFormat.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b2)
- * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
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  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -121,11 +121,12 @@
     a colour the feature).</p>
 
   <p>
     a colour the feature).</p>
 
   <p>
-    If your sequence annotation is already available in GFF Format (see
-    <a href="http://gmod.org/wiki/GFF2">gmod.org/wiki/GFF2</a>), then
-    you can leave it as is, after first adding a line containing only
+    If your sequence annotation is already available in <a href="http://gmod.org/wiki/GFF2">GFF2</a> (http://gmod.org/wiki/GFF2) or
+    <a href="https://github.com/The-Sequence-Ontology/Specifications/blob/master/gff3.md">GFF3</a> 
+    (http://github.com/The-Sequence-Ontology/Specifications/blob/master/gff3.md) format, 
+    then you can leave it as is, after first adding a line containing only
     'GFF' after any Jalview feature colour definitions (<em>this
     'GFF' after any Jalview feature colour definitions (<em>this
-      mixed format capability was added in Jalview 2.6</em>). Alternately,
+    mixed format capability was added in Jalview 2.6</em>). Alternately,
     you can use Jalview's own sequence feature annotation format, which
     additionally allows HTML and URLs to be directly attached to each
     piece of annotation.
     you can use Jalview's own sequence feature annotation format, which
     additionally allows HTML and URLs to be directly attached to each
     piece of annotation.