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update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / help / html / features / featuresettings.html
diff --git a/help/html/features/featuresettings.html b/help/html/features/featuresettings.html
index 390ad78..c0fbf32 100755 (executable)
--- a/help/html/features/featuresettings.html
+++ b/help/html/features/featuresettings.html
@@ -1,7 +1,7 @@
 <html>
 <!--
 <html>
 <!--
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
- * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
+ * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
@@ -31,17 +31,19 @@ Sequence Feature Settings for the Jalview Application</img></center>
 <p>The top section of the dialog box lists all the sequence feature
 groups, along with a tickbox for each that controls whether its features
 are displayed. The table in the middle lists all the features in the
 <p>The top section of the dialog box lists all the sequence feature
 groups, along with a tickbox for each that controls whether its features
 are displayed. The table in the middle lists all the features in the
-currently selected groups, along with their display colour and whether
+currently selected groups, along with their display style and whether
 they are currently being displayed (only the ticked features and groups
 they are currently being displayed (only the ticked features and groups
-are displayed). <strong><em>You can change the colour used
-for a feature in the associated alignment by clicking on its colour box.</em></strong></p>
+are displayed). <strong><em>You can change the colour or
+shading style used for a feature in the associated alignment by clicking
+on its colour box.</em></strong></p>
 <p><strong><em>Feature settings pop-up menu</em></strong><br>
 <strong>Right-click</strong> on a feature to open a pop-up menu that
 allows you to sort the alignment or current selection using that feature
 <p><strong><em>Feature settings pop-up menu</em></strong><br>
 <strong>Right-click</strong> on a feature to open a pop-up menu that
 allows you to sort the alignment or current selection using that feature
-type (see below), or create a <a href="featureschemes.html">feature
-colourscheme</a> based on either the scores associated with that feature or
-from the feature's description (e.g. to distinguish different names
-associated with a DOMAIN feature).</p>
+type (see below), or toggle the type of colouring used for the feature.
+Features may be highlighted with either a single colour or a <a
+       href="featureschemes.html">feature colourscheme</a> based on either the
+scores associated with that feature or from the feature's description
+(e.g. to distinguish different names associated with a DOMAIN feature).</p>
 <p><strong>Ordering alignment by features</strong><br>
 The 'Seq Sort by Score' and 'Seq Sort by Density' buttons will sort the
 alignment based on the average score or total number of currently active
 <p><strong>Ordering alignment by features</strong><br>
 The 'Seq Sort by Score' and 'Seq Sort by Density' buttons will sort the
 alignment based on the average score or total number of currently active