- //
- // if (treeCanvas.applyToAllViews)
- // {
- // final ArrayList<CommandI> commands = new ArrayList<>();
- // for (AlignmentPanel ap : PaintRefresher
- // .getAssociatedPanels(parentAvport.getSequenceSetId()))
- // {
- // commands.add(sortAlignmentIn(ap.av.getAlignPanel()));
- // }
- // parentAvport.getAlignPanel().alignFrame.addHistoryItem(new CommandI()
- // {
- //
- // @Override
- // public void undoCommand(AlignmentI[] views)
- // {
- // for (CommandI tsort : commands)
- // {
- // tsort.undoCommand(views);
- // }
- // }
- //
- // @Override
- // public int getSize()
- // {
- // return commands.size();
- // }
- //
- // @Override
- // public String getDescription()
- // {
- // return "Tree Sort (many views)";
- // }
- //
- // @Override
- // public void doCommand(AlignmentI[] views)
- // {
- //
- // for (CommandI tsort : commands)
- // {
- // tsort.doCommand(views);
- // }
- // }
- // });
- // for (AlignmentPanel ap : PaintRefresher
- // .getAssociatedPanels(av.getSequenceSetId()))
- // {
- // // ensure all the alignFrames refresh their GI after adding an undo item
- // ap.alignFrame.updateEditMenuBar();
- // }
- // }
- // else
- // {
- // treeCanvas.ap.alignFrame
- // .addHistoryItem(sortAlignmentIn(treeCanvas.ap));
- // }