- public ViewportPositionProps getPosProps()
- {
- return posProps;
- }
-
- @Override
- public int getStartRes()
- {
- return posProps.getStartRes();
- }
-
- @Override
- public int getEndRes()
- {
- return posProps.getEndRes();
- }
-
- @Override
- public int getStartSeq()
- {
- return posProps.getStartSeq();
- }
-
- public void setStartRes(int res)
- {
- posProps.setStartRes(res);
- // this.startRes = res;
- }
-
- public void setStartSeq(int seq)
- {
- posProps.setStartSeq(seq);
- // this.startSeq = seq;
- }
-
- public void setEndRes(int res)
- {
- posProps.setEndRes(res);
- /*if (res > alignment.getWidth() - 1)
- {
- // log.System.out.println(" Corrected res from " + res + " to maximum " +
- // (alignment.getWidth()-1));
- res = alignment.getWidth() - 1;
- }
- if (res < 0)
- {
- res = 0;
- }
- this.endRes = res;*/
- }
-
- public void setEndSeq(int seq)