- assertEquals(4, pf.chains.size());
- assertEquals("A", pf.chains.get(0).id);
- assertEquals("B", pf.chains.get(1).id);
- assertEquals("C", pf.chains.get(2).id);
- assertEquals("D", pf.chains.get(3).id);
+ assertEquals(4, pf.getChains().size());
+ assertEquals("A", pf.getChains().get(0).id);
+ assertEquals("B", pf.getChains().get(1).id);
+ assertEquals("C", pf.getChains().get(2).id);
+ assertEquals("D", pf.getChains().get(3).id);
+
+ PDBChain chainA = pf.getChains().get(0);
+ SequenceI seqA = pf.getSeqs().get(0);