JAL-3553 copy sha256sums to a versioned filename too when created
[jalview.git] / build.gradle
index ee7be0f..c60c88a 100644 (file)
@@ -52,6 +52,7 @@ repositories {
 }
 
 
+
 // in ext the values are cast to Object. Ensure string values are cast as String (and not GStringImpl) for later use
 def string(Object o) {
   return o == null ? "" : o.toString()
@@ -210,6 +211,8 @@ ext {
   install4jWindowsIconsFile = string("${install4j_images_dir}/${install4j_windows_icons_file}")
   install4jPngIconFile = string("${install4j_images_dir}/${install4j_png_icon_file}")
   install4jBackground = string("${install4j_images_dir}/${install4j_background}")
+  install4jBuildDir = "${install4j_build_dir}/${JAVA_VERSION}"
+  install4jCheckSums = true
   switch (CHANNEL) {
 
     case "BUILD":
@@ -316,6 +319,7 @@ ext {
     getdownAppBase = file(getdownWebsiteDir).toURI().toString()
     getdownLauncher = string("${jalviewDir}/${getdown_lib_dir}/${getdown_launcher_local}")
     install4jExtraScheme = "jalviewl"
+    install4jCheckSums = false
     break
 
     default: // something wrong specified
@@ -419,16 +423,16 @@ ext {
     '--add-modules', j11modules
     ]
      */
-  } else if (JAVA_VERSION.equals("12") || JAVA_VERSION.equals("13")) {
-    JAVA_INTEGER_VERSION = JAVA_VERSION
-    libDir = j11libDir
-    libDistDir = j11libDir
-    compile_source_compatibility = JAVA_VERSION
-    compile_target_compatibility = JAVA_VERSION
+  } else if (JAVA_VERSION.equals("17")) {
+    JAVA_INTEGER_VERSION = string("17")
+    libDir = j17libDir
+    libDistDir = j17libDir
+    compile_source_compatibility = 17
+    compile_target_compatibility = 17
     getdownAltJavaMinVersion = string(findProperty("getdown_alt_java11_min_version"))
     getdownAltJavaMaxVersion = string(findProperty("getdown_alt_java11_max_version"))
     getdownAltMultiJavaLocation = string(findProperty("getdown_alt_java11_txt_multi_java_location"))
-    eclipseJavaRuntimeName = string("JavaSE-11")
+    eclipseJavaRuntimeName = string("JavaSE-17")
     /* compile without modules -- using classpath libraries
     additional_compiler_args += [
     '--module-path', modules_compileClasspath.asPath,
@@ -1409,6 +1413,8 @@ jar {
   def outputDir = "${jalviewDir}/${package_dir}"
   destinationDirectory = file(outputDir)
   archiveFileName = rootProject.name+".jar"
+  duplicatesStrategy "EXCLUDE"
+
 
   exclude "cache*/**"
   exclude "*.jar"
@@ -1474,6 +1480,9 @@ shadowJar {
     attributes "Implementation-Version": JALVIEW_VERSION,
     "Application-Name": install4jApplicationName
   }
+
+  duplicatesStrategy "INCLUDE"
+
   mainClassName = shadow_jar_main_class
   mergeServiceFiles()
   classifier = "all-"+JALVIEW_VERSION+"-j"+JAVA_VERSION
@@ -1804,11 +1813,7 @@ task copyInstall4jTemplate {
 
     // turn off checksum creation for LOCAL channel
     def e = install4jConfigXml.application[0]
-    if (CHANNEL == "LOCAL") {
-      e.'@createChecksums' = "false"
-    } else {
-      e.'@createChecksums' = "true"
-    }
+    e.'@createChecksums' = string(install4jCheckSums)
 
     // put file association actions where placeholder action is
     def install4jFileAssociationsText = install4jFileAssociationsFile.text
@@ -1861,8 +1866,7 @@ clean {
   }
 }
 
-
-task installers(type: com.install4j.gradle.Install4jTask) {
+task installerFiles(type: com.install4j.gradle.Install4jTask) {
   group = "distribution"
   description = "Create the install4j installers"
   dependsOn getdown
@@ -1881,8 +1885,6 @@ task installers(type: com.install4j.gradle.Install4jTask) {
     filesMd5 = filesMd5.substring(0,8)
   }
   def install4jTemplateVersion = "${JALVIEW_VERSION}_F${filesMd5}_C${gitHash}"
-  // make install4jBuildDir relative to jalviewDir
-  def install4jBuildDir = "${install4j_build_dir}/${JAVA_VERSION}"
 
   variables = [
     'JALVIEW_NAME': jalview_name,
@@ -1975,6 +1977,34 @@ task installers(type: com.install4j.gradle.Install4jTask) {
   outputs.dir("${jalviewDir}/${install4j_build_dir}/${JAVA_VERSION}")
 }
 
+task addVersionToInstallersDataFiles {
+  dependsOn installerFiles
+
+  def installersOutputTxt = "${jalviewDir}/${install4jBuildDir}/output.txt"
+  def installersOutputVersionTxt = "${jalviewDir}/${install4jBuildDir}/output-${JALVIEW_VERSION}.txt"
+  def installersSha256 = "${jalviewDir}/${install4jBuildDir}/sha256sums"
+  def installersSha256Version = "${jalviewDir}/${install4jBuildDir}/sha256sums-${JALVIEW_VERSION}"
+
+  inputs.file(installersOutputTxt)
+  outputs.file(installersOutputVersionTxt)
+  if (install4jCheckSums) {
+    inputs.file(installersSha256)
+    outputs.file(installersSha256Version)
+  }
+
+  doFirst {
+    file(installersOutputVersionTxt).write(file(installersOutputTxt).text)
+    if (install4jCheckSums) {
+      file(installersSha256Version).write(file(installersSha256).text)
+    }
+  }
+}
+
+task installers {
+  dependsOn installerFiles
+  dependsOn addVersionToInstallersDataFiles
+}
+
 
 spotless {
   java {
@@ -2393,6 +2423,10 @@ task jalviewjsSyncAllLibs (type: Sync) {
   preserve {
     include "**"
   }
+
+  // should this be exclude really ?
+  duplicatesStrategy "INCLUDE"
+
   outputs.files outputFiles
   inputs.files inputFiles
 }
@@ -2640,7 +2674,7 @@ def jalviewjsCallCore(String name, FileCollection list, String prefixFile, Strin
           new org.apache.tools.ant.util.TeeOutputStream(
             logErrFOS,
             stderr),
-          errorOutput)
+          System.err)
     } else {
       standardOutput = new org.apache.tools.ant.util.TeeOutputStream(
         logOutFOS,