Merge branch 'issues/JAL-3553+JAL-3978+JAL-3989+JAL-4004_merged_with_develop' into...
[jalview.git] / examples / groovy / printtitle.groovy
index eb56410..b3387ea 100644 (file)
@@ -1,6 +1,6 @@
 /*
- * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.9.0b1)
- * Copyright (C) 2015 The Jalview Authors
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
+ * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
  * 
  * This file is part of Jalview.
  * 
  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  */
 // do something groovy in jalview
-print "Hello World.\n";
-def alf = Jalview.getAlignFrames();
+println "Hello World.\n"
+println "First sequence is " + currentAlFrame.viewport.alignment.getSequenceAt(0).getDisplayId(true)
+
+def alf = Jalview.getAlignFrames()
 for (ala in alf)
 {
        // ala is an jalview.gui.AlignFrame object 
-       print ala.getTitle()+"\n";
+       println ala.getTitle()
        // get the parent jalview.datamodel.Alignment from the alignment viewport
-       def alignment = ala.viewport.alignment;
+       def alignment = ala.viewport.alignment
        // get the first sequence from the jalview.datamodel.Alignment object
-       def seq = alignment.getSequenceAt(0); 
+       def seq = alignment.getSequenceAt(0) 
 }
+Jalview.quit()