added -rs option
[jalview.git] / forester / java / src / org / forester / application / mcc.java
index 70b520f..9f28424 100644 (file)
@@ -21,7 +21,7 @@
 // Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA
 //
 // Contact: phylosoft @ gmail . com
-// WWW: www.phylosoft.org/forester
+// WWW: https://sites.google.com/site/cmzmasek/home/software/forester
 
 package org.forester.application;
 
@@ -83,7 +83,7 @@ public class mcc {
                 msa = FastaParser.parseMsa( is );
             }
             else {
-                msa = GeneralMsaParser.parse( is );
+                msa = GeneralMsaParser.parseMsa( is );
             }
             if ( cla.isOptionSet( FROM_OPTION ) ) {
                 singleCalc( in, from, to, msa );