in progress
[jalview.git] / forester / java / src / org / forester / archaeopteryx / Configuration.java
index 3562e10..32cec55 100644 (file)
@@ -156,7 +156,7 @@ public final class Configuration {
             { "Phylogram", "display", "?" }, { "Node Name", "display", "yes" }, { "Taxonomy Code", "display", "yes" },
             { "Annotation", "nodisplay", "no" }, { "Confidence Value", "display", "?" }, { "Event", "display", "?" },
             { "Taxonomy Colorize", "display", "yes" }, { "Colorize Branches", "display", "no" },
-            { "Use Branch-Width", "nodisplay", "no" }, { "Show Custom Nodes", "display", "yes" },
+            { "Use Branch-Widths", "display", "no" }, { "Show Custom Nodes", "display", "yes" },
             { "Domains", "nodisplay", "no" }, { "Binary Characters", "nodisplay", "no" },
             { "Binary Char Counts", "nodisplay", "no" }, { "Prot/Gene Name", "display", "yes" },
             { "Prot/Gene Acc", "display", "no" }, { "Show Internal Data", "display", "yes" },
@@ -168,9 +168,9 @@ public final class Configuration {
     final static String                     clickto_options[][]                                    = {
             { "Display Node Data", "display" }, { "Collapse/Uncollapse", "display" }, { "Root/Reroot", "display" },
             { "Sub/Super Tree", "display" }, { "Swap Descendants", "display" }, { "Colorize Subtree", "display" },
-            { "Open Sequence Web", "nodisplay" }, { "Open Taxonomy Web", "nodisplay" }, { "Cut Subtree", "display" },
+            { "Open Sequence Web", "display" }, { "Open Taxonomy Web", "display" }, { "Cut Subtree", "display" },
             { "Copy Subtree", "display" }, { "Paste Subtree", "display" }, { "Delete Subtree/Node", "display" },
-            { "Add New Node", "display" }, { "Edit Node Data", "display" }, { "Blast", "display" } };
+            { "Add New Node", "display" }, { "Edit Node Data", "display" }, { "Blast", "nodisplay" } };
     // This option is selected in the dropdown
     int                                     default_clickto                                        = Configuration.display_node_data;
     // --------------
@@ -218,7 +218,7 @@ public final class Configuration {
         }
     }
 
-    Configuration( final String cf, final boolean is_url, final boolean is_applet ) {
+    public Configuration( final String cf, final boolean is_url, final boolean is_applet ) {
         if ( ForesterUtil.isEmpty( cf ) ) {
             config_filename = default_config_filename;
         }