inprogress
[jalview.git] / forester / ruby / scripts / x.rb
index cb70c70..883b215 100644 (file)
@@ -6,10 +6,10 @@ Dir.foreach(".") do |f|
     cmd = "#{PRG} -ie=10 -a -pe=1 -m=RRMa -s=#{taxon} #{taxon}.hmmscan_260 #{taxon}_ie10_domain_table > #{taxon}_ie10_summary_table.txt"
     puts cmd
     output = IO.popen( cmd )
-  elsif f =~ /^([A-Z0-9]{3,6})_cdhit090\.hmmscan_260/  
+  elsif f =~ /^([A-Z0-9]{3,6})_cdhit090\.hmmscan_260/
     taxon = $1
     cmd = "#{PRG} -ie=10 -a -pe=1 -m=RRMa -s=#{taxon} #{taxon}_cdhit090.hmmscan_260 #{taxon}_cdhit090_ie10_domain_table > #{taxon}_cdhit090_ie10_summary_table.txt"
     puts cmd
     output = IO.popen( cmd )
-  end  
+  end
 end
\ No newline at end of file