JAL-4020 class formatting
[jalview.git] / getdown / src / getdown / core / src / main / java / com / threerings / getdown / data / Application.java
index 468796c..8048728 100644 (file)
@@ -31,8 +31,7 @@ import java.util.zip.GZIPInputStream;
 
 import jalview.bin.HiDPISetting;
 import jalview.bin.MemorySetting;
-import jalview.bin.LaunchUtils;
-import jalview.util.ChannelProperties;
+import jalview.util.LaunchUtils;
 
 import com.threerings.getdown.util.*;
 // avoid ambiguity with java.util.Base64 which we can't use as it's 1.8+
@@ -1184,17 +1183,8 @@ public class Application
         }
 
         // use saved preferences if no cmdline args
-        File channelProps = getLocalPath(ChannelProperties.CHANNEL_PROPERTIES_FILENAME);
-        if (channelProps.exists()) {
-          try {
-            InputStream is = new FileInputStream(channelProps);
-            ChannelProperties.loadProps(is);
-          } catch (IOException e) {
-            log.error(e.getMessage());
-          }
-        }
-        boolean useCustomisedSettings = Boolean.parseBoolean(LaunchUtils.getUserPreference(MemorySetting.CUSTOMISED_SETTINGS));
-        if (useCustomisedSettings) {
+        LaunchUtils.loadChannelProps(getAppDir());
+        if (LaunchUtils.getBooleanUserPreference(MemorySetting.CUSTOMISED_SETTINGS)) {
           if (jvmmempc == null) {
             jvmmempc = LaunchUtils.getUserPreference(MemorySetting.MEMORY_JVMMEMPC);
           }
@@ -1258,7 +1248,7 @@ public class Application
           if (j > -1) {
             ext = filename.substring(j+1);
           }
-          if (ext != null && LOCATOR_FILE_EXTENSION.equals(ext.toLowerCase())) {
+          if (ext != null && LOCATOR_FILE_EXTENSION.equals(ext.toLowerCase(Locale.ROOT))) {
             // this file extension should have been dealt with in Getdown class
           } else {
             _appargs.add(0, "-open");
@@ -1274,7 +1264,9 @@ public class Application
         String[] sargs = args.toArray(new String[args.size()]);
         log.info("Running " + StringUtil.join(sargs, "\n  "));
 
-        return Runtime.getRuntime().exec(sargs, envp, getAppDir());
+        // don't set the working dir, leave it the same as the working dir of the invocation
+        //return Runtime.getRuntime().exec(sargs, envp, getAppDir());
+        return Runtime.getRuntime().exec(sargs, envp);
     }
 
     /**
@@ -2005,7 +1997,7 @@ public class Application
         String locatorFilename = filenames.length >= 1 ? filenames[0] : null;
         if (
                 !StringUtil.isBlank(locatorFilename)
-                && locatorFilename.toLowerCase().endsWith("."+Application.LOCATOR_FILE_EXTENSION)
+                && locatorFilename.toLowerCase(Locale.ROOT).endsWith("."+Application.LOCATOR_FILE_EXTENSION)
                 ) {
           setLocatorFile(locatorFilename);
           // remove the locator filename from the filenames array
@@ -2019,7 +2011,7 @@ public class Application
           // skip any other locator files in a multiple file list
           if (filename.startsWith("jalview://") || filename.startsWith("jalviews://")) {
             setJalviewUri(filename);
-          } else if (! filename.toLowerCase().endsWith("."+Application.LOCATOR_FILE_EXTENSION)) {
+          } else if (! filename.toLowerCase(Locale.ROOT).endsWith("."+Application.LOCATOR_FILE_EXTENSION)) {
             addStartupFile(filename);
           }
         }